Mercurial > repos > pimarin > data_manager_fetch_plasmidfinder
diff plasmidfinder-db/NT_Rep.fsa @ 3:5ffc68b4ec04 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/data_managers/data_manager_fetch_plasmidfinder commit 5c04f6f49deca3735a752e5ac29027ba9d5ff000-dirty
author | pimarin |
---|---|
date | Fri, 17 Feb 2023 14:03:19 +0000 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/plasmidfinder-db/NT_Rep.fsa Fri Feb 17 14:03:19 2023 +0000 @@ -0,0 +1,16 @@ +>rep3_1_rep63A(pAW63)_BTH011655 +atgaatacagtacaaaaagctattgaattaatactacataaagggttacgaaaatataaatctaaaaattcgaaagctggactagtatctattgcacatcaagagaaatttgaaagcaaagtgttaaatgggaagaagaataaaaagggttcaatttttattactcgtaagaaagaagatttaagcgctaagtttgggactcgtggcgtagtattatcttctgaagaagctgtactggatcatgtaggacaggcttctcactggacacctaatgtatataattttggtacatatggtcaaaatggtcttcgtacaattgtagggcatacggaaaagaacctacaacaaattaactgttttgttattgatattgattcaaagtcattccctatgactgcgattaatgatgtggcattaaatgcaggttttggtgtaccgactatgattcttgaaacaacgaagggttatcaagtgtattatgtgttggataaagctgtgtacgtatcaaataacaagaactttatagctattaaatcagcgaaacgtatctctcaaaacttaagagaaatgtttgctgagagtttgccaaacgtggatttaacatgcaatcactttgggttcttcagaatgccttcagttcaaaatgttgtgatgttctttgaggaaaatgtgtatacattcaaggagttacaggagtggagcaagcgtcaagacgacaataagggaaatgaacagtttcataatgtgatagagagtccttttgctaaaaacactcctgtagagcaaccaaagcaaatggatgaactatggttcaaacaagtaattagttgtacaaatgtatctccaaaacaaacaaaggcagggcgaaacaatgcgatttttaccctttctttagcgtgtttccaaagtcaatatgctattaaagacacaatggacttaatggatcagtttaatagtaacctagagcaaccgctagatcacacagaggttagaggaattgttatgtctgcatactctggaaagtaccaggcagcacataaagattacatagagcgtttattacaaacatacggtgtgggtggacaagcttcagcttttcgtgcaccttcagtattgtggaagaaacataagaaacaacgtaaggatcgtgtgcgtagtcattggcatgaatgggaagctgacattattactttcttatccatgaattcaaaaaacaaacctgtgctatactttacacaatcagaactgtgcgaagcgcttaacattccccgcagcacattaaacacggttctaaagaagagtacaaaaatccataaaacggttgagggaaaagggaaaacagcaaaaacaggattttctacaatcggcatgctaattgcatttgcattaaaagaaaatggcaaaagaagagagagctatttaaactacttacaagggctatttcctcaaatgggtaatattcttggacaagcaaaaacaagtaacgccatagaagaacaagagacactttacagcatattagaagggctaccagctggttaa +>rep3_2_rep165(pBMB165)_DQ242517 +atgaatacagtacagaaagctattaatcttatacttcataaagggatacgaaaatataaatctaaaaactcaaaagctgctctagtatctattacaaaacaagagaaatttgaagacaaaatgctgaatggtaagaagaataaaaaaggatctatttttattactcgtaaaaaagctgatttaagcgcaccttttggtacaagaggagtagtgttaacatctgaggaagctacactggatcatgttggacaagcttctcactggactcctaatgtatataattttggtacatatagtgaaaatggccttcgtacaattgttggccacactgaaaaaaacctacaacaaattaattgctttgtaattgatattgattcaaagtcattcccaatgaaagcgattaatgatgttgcgttaaatgctggctttggtgtgccaactatgattcttcaaacaacaaagggttaccaggtgtattacgtgctggataaagctgtatatgtaacgaataaaaagaactatattgctattaaatcagcaaaaagaatctctcaaaacttgagagaaatgtttgctgaaagcctaccacaagtagatttaacatgtaatcactttggcttcttcagaatgccttcagaagagaatattattatgttctttgaggaaaatgtatattctttcaaggagttgcaggattggagtaagagacaagatgataacaaaggtaaagaatttttcgcaattccaggtgaaaataacgtaattgaaactccattttcaaaaaacaaacctgtagagcagccaaaacaggtagaagaagcgtggtttaagcaagttatcaattgtacgaacatagcgccacaacaaacaaaagcagggcgtaataatgcaatttttactctttcattagcatgtttccaaagtgaagtatcaattaaagaaacactagatatgatggaccagtttaatagcaacctggaacagcctttagatcatgttgaggttagagggattgtcatgtctgcatattcaggaaagtaccaggctgctcataaagattacatagatcgtctacttcaaacatatgcgacacctgaacaagttaattcgtttagatcaccagctgcattttggagaaaacataaaaagaaacgtgaagatcgagtacgttctcactggcatgagtgggaagcagatattattgctttcctgtcaattaattcaaaaaataaacctgtgctatactttacacaaaaagaactatgtgaagctattaatattcctagaagtactctaaatactgtcttgaaaaagagtaataaaatatataaaactgttgaaggaaaagggaaaactgcaaaaacaggcttttcaacaattggcatgttaatttcctttgcattacgtgaaaaagggcaaaaaagggagagttatttaatctatttaaacgagctgtttccccaaatgggtaatatcttactacaagcaaaaaacaatagcgctatggcagaagaaacggcattatacagcctaatcgaagggctgccagctggttaa +>rep3_3_rep(pBT9727)_CP000047 +atgaatacagtacagaaagctattaatcttatacttcataaaggtttacgaaaatataaatctaaaaactcaaaagctgctctagtatcaattacaaaacaagagaaatttgaagacaaaatgctgaatggtaagaagaataaaaaaggatctatttttatcactcgtaaaaaagctgatttaagtgcaccgtttggtacaagaggagtagtgttaacatctgaggaagctgcactggatcatgttggacaagcttctcactggactcctaatgtatataattttggtacatatagtgaaaatggtcttcgtacaatcgttgggcatacggaaaagaacttacagcaaattaattgcttcgtaattgatattgattcaaagtcattcccaatgacagcaatcaatgatgttgcgttaaatgctggttttggtgtgccgactatgatccttcaaactacaaagggttaccaagtatattatgtgttagataaagctgtatatgtaacaaataaaaagaactatattgctattaaatcagcaaaaagaatctctcaaaacttgagagaaatgtttgctgaaagcctaccacaagtagatttaacgtgtaatcattttggcttcttcagaatgccttcggaagagaatattattatgttctttgaggaaaatgtatattctttcaaggaactgcaggattggagtaagagacaagatgataacaaaggtaaagaatttttcgcaattccaggtgaaaacaacgttattgaaactccattttctaaaaataaacctgtagagcagccaaaacaggtagaagaagcttggtttaagcaaattataaattgtacgaatatagcgccacaacaaacaaaagcagggcgtaataatgcgattttcactctttcattagcttgtttccaaagtgaaatatcaattaaggaaacactagatatgatggatcagtttaatagtaacctggaacaacctttggatcatgctgaggttagaggaattgtcatgtctgcatattcaggaaaataccaggctgcacacaaagactacattgatcgtctacttcaaacatatgggacacctggacaagttaattcatttagatcaccagctgcattttggagaaaacacaaaaagcaacgtgaggatcgagtacgttctcattggcatgagtgggaagcggatattattgcgttcctgtcgatgaattcgaacaacaaacctgtgctatactttacacaaaaagaattatgtgaagcaattaatattcctagaagtaccctaaacactgttctgaaaaagagcaataaaatatataagactgttgaagggaaaggaaaaactgcaaaaacaggtttttcaacaattggcatgttaatttcgtttgcattacgtgaaaaaggagaaaaaagagagagttatctaagctatttaaacgagctgtttccccaaatgggtaatatcttactacaagcaaaaaacaatagcgctatggcagaagaaacagtgtcttatagcctaatcgaagggctaccagctggttaa +>rep3_4_CDS38(pOX2)_NC002146 +atgaatacagtacaaaaagctatcgaattaatactacataaaggattacgaaaatataaatctaaaaattcaaaagctggattagtatctattgctaatcaagagaaatttgaaagtaaagtgctcaatggtaagaagaataaaaaaggatcaatttttattactcgtaagaaagaagatttaagggctaagtttgggactcgtggcgttgtattatcatctgaagaagctgtactggatcatgttggacaggcttctcactggacacctaatgtatataattttggtacatatggtcaaaatggtcttcgtacaattgtagggcatacggaaaagaacctacaacaaattaactgttttgttattgatatagattcaaagtcattccctatgactgcaatcaatgatgtggcacttaatgcaggttttggtgtaccgactatgattcttgaaacaacaaagggttatcaagtgtattatgtgttggataaagcggtgtacgtatcaaacaacaagaactttatagctattaaatcagcgaaacgtatttctcaaaatctacgagaaatgtttgctgatagtttgccaaacgtggatttaacatgcaatcactttggtttcttcagaatgccttcagttcaaaatattgtaatgttctttgaggaaaatgtttatacattcaaggagttacaagaatggagcaagcgacaagacgacaacaaaggcaatgaacagtttcataatgtaatagagagtccttttgctaaaaacgctcctgtagagcagccgaagcaaatggatgaattatggttcaaacaagtaattagttgtacaaatgtatctccaaaacaaacaaaagcagggcgaaacaatgcgattttcaccctttctttagcgtgttttcaaagtcaatatgctattaaagacacaatggacttaatggatcagtttaatagtaacctagagcaaccactagagcatactgaagttagagggattgtgatgtctgcatactctggaaaataccaggcggcacataaagattacatagaacgattactacaaacatatggaatgggacaggcttcagcgttccgtgcgccttctgtactttggaagaaacataagaaacaacgtaaagatcgtgtgcgtagtcattggcacgagtgggaagctgatattattaccttcctatccatgaattcaaacaacaaacctgtgctatactttacacaatcagaactgtgcgaagcgcttaacgttccccgcagcacattaaacacggttctaaaaaagagtacaaaaatctataaaacggttgagggaaaagggaaaacagcaaaaacaggattatctacacttggaatgctaattgcgtttgctttaaaagaaaatggcaaaagaagagagagctacctaaactacttacaagggctattccctaaaacaggtaatattcttgaacaagcaaaaacaagcaatgtcatggaggaacaagaaacactatacggcatattggaagggctaccagctggttaa +>repUS2_1_repA(pBI143)_BFU30316 +Atgatactaaataggaaaataatatttcccttaatattgtttttatggaaaataatagtttactttgtggagaataatatttcccaaaaacatatcaaaatggaaaataaaaaagcagttaagttaaccgattttcaaaagaagcaagaaaatccttttatgaaaacaagctatagaggtattgaaaatcatgttgttaaaaagtataagagtaatagtggtggcgataagagagctgtagtagctttagccgacactgaaactggagaagtgtttaagacttcgtttatccgtcaaatagaagtagatgaagaacaattcactaaattgtatctttctaactttgctgcattctttgacctatcacaagcagctattcgggtttttggttactttatgacctgcatgaaacccaaaaatgatttaatcattttcaatagaaaaaaatgcctagaatataccaaatacaaaacagacaaagccgtttataaaggacttgcagaacttgtaaaagctgaaatcatagcccgaggaccagccgataatctttggtttattaatcctctgatagtattcaatggtgaccgagtgacatttgctaaaacatacgtttcggaaaaagactttagctgcccaaaagaaagaagaagcagagaaacgacaattatcacttggctttga +>repUS3_1_repM200(pBM200)_DQ437521 +Gtgaatttggaaaaaaaacttgctgaagcggaaaaaaaggcaagattaaaagatttcaaaaataaatcatattcatcagaagaagtctctgatattcaaagatcattattagatctaatgcaggaaattacaggtgaaaaacattttatcggtaaggaaaaggatatttttgcaggggagccgtttaatcaaactatgcatagaaatttagatttgttgactagaataaattatttaacaactgctgaggaaagctttttgtttagaattcaagcttatttagagtttaaaagtaatgttattatttgcagagaagacaaatttaaaaagaaacgtaataatgttgtagatgatgattatgagcttcctaaggcagcaacagtttcagaaattgcagaaatgattggtaagtctagggaaaaaacttctttaattatgaattctttaaagaaaaaagagattttattaaatcctgaaggtgcaggacaagttagtgaaaatggtcgttctgtaagccctagaacgtggattgtaaatccttatattatgatttgtgctccgcgtaaaaacgaagttaagttagataaattaacaatgagattatttcagcattctttaaaaaaccttaaagatccgaatggaaaaaaagtaaatttgccagttagatttttttaa +>repUS6_1_rep(pFL1)_NC002132 +atgagttataaaaaagaaagtaaattatcaaattatgataagcataaagagaatccgtttttaaaagaagcagtagaacaaattcagcataatattgtaaaaaaatacaagagtacaggaggtacaagtcaaagcgcaattttacaagctgtaaattcagatggagagttagttggtcatacttcgtttattagacaaatagaagtagatgaagagcaattcacgaaaatttatttggctcaattttcttctttttggaatttaaaaacacaagcaataagggtttttggttatattatgacgaaattaataccaaggcaagatacttttatgttttttctagatgaatgtatggaatacacaggctataaaggcaaaaacagtatttatattggtcttactagtttagtagaaaacaatataattgcgaggggtagaaatgatagccattattttataaatccaatggtagcgtttaatggggatagagtaacgtttgcaaaacttatataa +>repUS8_1_ORF1(pOg32)_LOPPOG32 +Atgaccaaaacatctattgaaaagccggccccttctaacagccggctaagtgtaaaaaatgtttacacttcatctataaagtggagcattgaccgtctaacgattgttggagaacttgctccattcttacctgcggggtatacaactaacaaaatatctggcgaagttaaaagcagaattactattgaagatatgttcaaagtttttgaacattttggtcattgtcgtttgtccggaaatggttatcaaatgataaccgatgatggagagaacgttgcttattttgaacgattaaagtttgacaaaaataaagggcgcttagattttaacccgaacaagttagatagtttttttgaaaatggcttgaagcaatttatatctgatttattcatcacgccccatttttcaagggctgacattgctgccgatatttttgatgtccccgatgaaaaagttgtgtcttaccgattaggtgaaccagttggaaatacatttttttatggaaaaagtggagatttacagaccgcgtattttggtgccaggtcatcagagaaacaaataaggctctataacaaaagaattgaaagaatcaaaaaaggcagaattgaagaccttaaagaccccgaacaatgctactggcggttagaactacaactaagacgcgggagggctgatgattttcaaaagcaggtcgacgagagtttgaaacatttttattctccgcaagattttcctgatgatgtgtctgtgaacagcagaatatttttgaaagggctacttgcagaccctgataactgggctagaatatcaagaccaacgaagtcaaaatatagacagatagaggaacgagttgcctcttctgacaaattaacaattgaattgaaaaaaactttttctcaacaaaataaaaaaatagaaaaagaattgaagaattggctacagacttttcaagttttgtag