Mercurial > repos > iuc > gatk4_mutect2
directory /test-data/ @ 8:55e8a08e39e1 draft default tip
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 cached_locally/
|
drwxr-xr-x | |
 Mutect2-in1.bam
|
40635 | -rw-r--r-- |
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Mutect2-in2.bam
|
44242 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-in2.dict
|
168 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-in3.bam
|
142870 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-in4.bam
|
22172 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-in5.bam
|
33950 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out1.vcf
|
20975 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out2.vcf
|
29559 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out3.vcf
|
18782 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out4.vcf
|
20315 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out5-1.tabular
|
2457 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out5.bam
|
21488 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out5.vcf
|
23001 | -rw-r--r-- |
|
Mutect2-out6.vcf
|
16453 | -rw-r--r-- |
|
all_fasta.loc
|
128 | -rw-r--r-- |
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applybqsr_expected.bam
|
17199 | -rw-r--r-- |
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bqsr_expected.table
|
210627 | -rw-r--r-- |
|
bqsr_input.bam
|
42340 | -rw-r--r-- |
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bqsr_interval.interval_list
|
597 | -rw-r--r-- |
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chr20.fa
|
64075953 | -rw-r--r-- |
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hc_expected.vcf
|
4650 | -rw-r--r-- |
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hc_input.bam
|
17577 | -rw-r--r-- |
|
hc_interval.interval_list
|
833 | -rw-r--r-- |
|
normal.bam
|
67168 | -rwxr-xr-x |
|
reference.fa
|
9728 | -rw-r--r-- |
|
split_expected.bam
|
14998 | -rw-r--r-- |
|
split_input.bam
|
406103 | -rw-r--r-- |
|
split_interval.interval_list
|
879 | -rw-r--r-- |
|
test_dbsnp.vcf.gz
|
54037 | -rw-r--r-- |
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test_mills.vcf.gz
|
4133 | -rw-r--r-- |
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test_ref.fasta
|
40675 | -rw-r--r-- |
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test_ref.fasta.fai
|
20 | -rw-r--r-- |
|
tumor.bam
|
67349 | -rwxr-xr-x |