Mercurial > repos > pimarin > data_manager_fetch_plasmidfinder
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planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/data_managers/data_manager_fetch_plasmidfinder commit 5c04f6f49deca3735a752e5ac29027ba9d5ff000-dirty
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-ATGTTGAATAGTTGCGAGTATGCGGACGTTTTAGCTAAAATTCTTAAAAATGGAATTAAACAGTTTAATAGCAAAAATCTAGTTGCTTTTAAAAAGAATAGCAATAAGATTGGTGCTATTGCCGGATTTACTTCTAAAACAAACATGATAAAGACTAAAGGTCTTATATATCGTTCTATTGATCGTGTCTTGGAAGATTCAGATGTATTAACACACTGGACTCCTAACGTGTATTCATGGCTTGGTGGCGGTGAAAACAAAACAATTTTTGGTCACAAAGAAGCTAACTTAATTCAGATTAATACTTTTGTAGCAGATATTGACTATCCAGTAGGAGAAAAGAAAACGGATTTGAATTTACTAGTTCTTTATCTATTGGAAGAAGGGTTATTGCCTACACTGATTGTAGATACGCCAAAAGGTTATCATTGCTATTTTCTGATTCAAAACTATAACCAAGAAACTGATTCATTTGATAAGGCAAGCTATATTTCTAATTCAAATGATTTTAAATCTTTGAGAGTTGCTAAAAGAATATCAGAAAATATCAGAAAATCTATCCAAAATCGTTTACCACAAGTCGATATGGGCTGTAATCATTTTGGTATTTTTAGATTTCCAACTAAAAAAAATATTGTACATTATGAACCTAATTTCGTAGATACGTTTGAAGGGTATTTGAAATGGTCAAAAGACTTTGAAGAAAAAGAATATGCTTTAAAGAGGTCTAACTTGTCATTATTAGCTCCTAATTCTACTGGCAAGAAAGGGTCTAAACGACAAATTGATACTAAATGGTACGACTTTTTAATTCATACGGATATTGCTGAAGGAGATAGAAATAAAACTATTTTTACCTTAGCCCTGGCATGTAAATCAAGTGGCTTATCTATTGGCGAGTGTATGGATCAATTGGATCAACTTCAATTCAATAATGATTTGTCCTATTCTGAAGTTGAGAGAACAATAAGAAGTGCTTATCGTGGCGATTACAAAGGTGCTAAAAGTTCATATGTCAATGAAATTATCGAAAATTATGCTACACCTACCGAGTTTGAAAAATACTCAATAAATGTAAATAGACAAGCTGTTAAACGTAAAGGGAATCGTGTCGATCCGTCTAATTGGGTGAAATTTGCTAAACCTAGAGAAGAACGAAAATATAGTCATTTTGAAGAAAGTAAAGCTGATTTATTAGCTTACTTAGAAAGAAAACAAAGATCATTGAAAAAAAATGAGTTGTTTTTAAGTGTCTCTATGGGAACTATATCTGAAGAAACACAAATTCCTGTATCTACGTTAAAGGTGATTTTAAAAGAGCTTAGAACGGCGAATACAGTGATATTACGAACGTCTCGTGGTCGGTATGGATCGACTAAAATAGCAACAAGCAAATTTGTGGAAGCTAAAATATTAAATACAGTTATTCAGAATAAAAAAGATAAACAAGTATTTGTCTTAGAATTATTAGGAACAGCAAATAGCCACGTAGAAACGATTTTAAGACGTTATGAAGACAAAACAGTACCGTTCCATGCGAACATACTGAAAGAAAGAGAAAAGAGCAAACATGCGCCAATTAGAGGAGCTAATACAGGTTAG 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-atgttgaatagttgcgagtatgcggacgttttagctaaaattcttaaaaatggaattaaacagtttaatagcaaaaatctagttgcttttaaaaagaatagcaataagattggtgctattgccggatttacttctaaaacaaacatgataaagactaaaggtcttatatatcgttctattgatcgtgtcttggaagattcagatgtattaacacactggactcctaacgtgtattcatggcttggtggcggtgaaaacaaaacaatttttggtcacaaagaagctaacttaattcagattaatacttttgtagcagatattgactatccagtaggagaaaagaaaacggatttgaatttactagttctttatctattggaagaagggttattgcctacactgattgtagatacgccaaaaggttatcattgctattttctgattcaaaactataaccaagaaactgattcatttgataaggcaagctatatttctaattcaaatgattttaaatctttgagagttgctaaaagaatatcagaaaatatcagaaaatctatccaaaatcgtttaccacaagtcgatatgggctgtaatcattttggtatttttagatttccaactaaaaaaaatattgtacattatgaacctaatttcgtagatacgtttgaagggtatttgaaatggtcaaaagactttgaagaaaaagaatatgctttaaagaggtctaacttgtcattattagctcctaattctactggcaagaaagggtctaaacgacaaattgatactaaatggtacgactttttaattcatacggatattgctgaaggagatagaaataaaactatttttaccttagccctggcatgtaaatcaagtggcttatctattggcgagtgtatggatcaattggatcaacttcaattcaataatgatttgtcctattctgaagttgagagaacaataagaagtgcttatcgtggcgattacaaaggtgctaaaagttcatatgtcaatgaaattatcgaaaattatgctacacctaccgagtttgaaaaatactcaataaatgtaaatagacaagctgttaaacgtaaagggaatcgtgtcgatccgtctaattgggtgaaatttgctaaacctagagaagaacgaaaatatagtcattttgaagaaagtaaagctgatttattagcttacttagaaagaaaacaaagatcattgaaaaaaaatgagttgtttttaagtgtctctatgggaactatatctgaagaaacacaaattcctgtatctacgttaaaggtgattttaaaagagcttagaacggcgaatacagtgatattacaaacgtctcgtggtcggtatggatcgactaaaatagcaacaagcaaatttgtggaagctaaaatattaagtacagttattcagaataaaaaagataaacaagtatttgtcttagaattgttaggaacagcaaatagtcacgtagaaacgattttaagacgttatgaagacaaaacagtaccgttccatgcgaacatactgaaagaaagagaaaagagcaaacatgcgccaattagaggagctaatacaggttag 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--- a/plasmidfinder-db/config Fri Feb 17 14:03:19 2023 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,13 +0,0 @@ -# Database configuration file - Describes the content of the database -# Each db consist of 1 file(s) with the following extensions: fsa -# Other important files are: notes.txt -#db_prefix name description -enterobacteriales Enterobacteriales Enterobacteriales -Inc18 Gram Positive Inc18 -NT_Rep Gram Positive NT_Rep -Rep1 Gram Positive Rep1 -Rep2 Gram Positive Rep2 -Rep3 Gram Positive Rep3 -RepA_N Gram Positive RepA_N -RepL Gram Positive RepL -Rep_trans Gram Positive Rep_trans
--- a/plasmidfinder-db/enterobacteriales.fsa Fri Feb 17 14:03:19 2023 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,288 +0,0 @@ ->pKPC-CAV1321_1__CP011611 -ATGGTTACCAGGGCTTTCTCTGTAACAGAGAGAGAGACAGGTAAAGAAATTATTTTACGTCCTAATAGCAGCAGGACGGTTCAGTCTATCGCGCTCATGCGCCTTGGGTTGTTTGTGCCATCACCAAAAAGCGTTGGCCGTCAGAGTCGTGAATACAAAACTGTTGGCTTTGATGCCACGAAAGAACTACAGACACTTTCTTTGATGGAGAGCGAGGGTTTCACCAATATCTCGATCGTGGGTCAGCGCCTCGATATGTCTGTTGACTTCAAAACGTGGATGGGAATCATCCGAACGCTAGCTAACCATCCGATTGATAACGATAAGATCAGCCTCAAATTTACTGAGTTTCTGAAGCTCTGTAACCCTGAAAATTATCGTTCCTCTACCGCATCCCGTAAGCGTATCGACGCGTCGTTACGCAGGCTGGCATCCGTGATGTTGTCCTTCACCAGCACCCACTCGTCAAAGGTGTATACGACGCACCTGGTGCAGTCTGCCTTGCTTGACCCGGACTCTGATCAGGTAGAGCTACAGATAGACCCTAAGATATTCGAGTTGTATCAGTACGACCACAAGGTTTTGATGCAGCTGAA ->IncHI1B(R27)_1_R27_AF250878 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