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date Mon, 15 May 2023 14:20:18 +0000
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3 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 aph(3')-III kanamycin, amikacin 100.00 100.00 795/795 contig00046 3229 2435 M26832 ATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAG
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4 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 cat(pC221) chloramphenicol 97.69 100.00 648/648 contig00048 4344 4991 X02529 ATGACTTTTAATATTATTGAATTAGAAAATTGGGATAGAAAAGAATATTTTGAACACTATTTTAATCAGCAAACTACTTATAGCATTACTAAAGAAATTGATATTACTTTGTTTAAAGATATGATAAAAAAGAAAGGATATGAAATTTATCCCTCTTTAATTTATGCAATTATGGAAGTTGTAAATAAAAATAAAGTGTTTAGAACAGGAATTAATAGTGAGAATAAATTAGGTTATTGGGATAAGTTAAATCCTTTGTATACAGTTTTTAATAAGCAAACTGAAAAATTTACTAACATTTGGACTGAATCTGATAAAAACTTCATTTCTTTTTATAATAATTATAAAAATGACTTGCTTGAATATAAAGATAAAGAAGAAATGTTTCCTAAAAAACCGATACCTGAAAACACCATACCGATTTCAATGATTCCTTGGATTGATTTTAGTTCATTTAATTTAAATATTGGTAACAATAGCAGCTTTTTATTGCCTATTATTACGATAGGTAAATTTTATAGTGAGAATAATAAAATTTATATACCAGTTGCTCTGCAACTTCATCATTCTGTATGTGATGGTTACCATGCTTCACTATTTATGAATGAATTTCAAGATATAATTCATAGGGTAGATGATTGGATTTAG
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5 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 dfrG trimethoprim 100.00 100.00 498/498 contig00049 275 772 AB205645 ATGAAAGTTTCTTTGATTGCTGCGATGGATAAGAATAGAGTGATTGGCAAAGAGAATGACATTCCTTGGAGGATTCCCAAGGACTGGGAATATGTTAAAAATACTACAAAGGGACATCCGATAATATTAGGTAGGAAGAACCTTGAATCAATCGGAAGAGCCTTACCTGACAGAAGAAATATTATTCTGACGAGAGATAAGGGGTTTACCTTTAATGGTTGTGAAATTGTTCATTCAATAGAAGATGTTTTTGAGTTATGTAAAAACGAAGAAGAAATTTTTATTTTCGGAGGAGAACAGATTTATAATTTGTTTTTCCCTTATGTTGAGAAAATGTACATCACAAAAATACATCATGAATTCGAAGGAGATACTTTTTTTCCAGAAGTGAATTATGAGGAATGGAATGAGGTATTTGCCCAAAAAGGGATAAAGAATGATAAAAATCCGTATAACTACTATTTTCATGTATATGAAAGAAAAAACTTATTGAGTTAA
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6 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 erm(B) erythromycin, azithromycin 99.21 100.13 763/762 contig00048 961 199 X66468 ATGTAATCACTTCAGGAGTGATTACATGAACAAAAATATAAAATATTCTCAAAACTTTTTAACGAGTGAAAAAGTACTCAACCAAATAATAAAACAATTGAATTTAAAAGAAACCGATACCGTTTACGAAATTGGAACAGGTAAAGGGCATTTAACGACGAAACTGGCTAAAATAAGTAAACAGGTAACGTCTATTGAATTAGACAGTCATCTATTCAACTTATCGTCAGAAAAATTAAAACTGAATACTCGTGTCACTTTAATTCACCAAGATATTCTACAGTTTCAATTCCCTAACAAACAGAGGTATAAAATTGTTGGGAGTATTCCTTACCATTTAAGCACACAAATTATTAAAAAAGTGGTTTTTGAAAGCCATGCGTCTGACATCTATCTGATTGTTGAAGAAGGATTCTACAAGCGTACCTTGGATATTCACCGAACACTAGGGTTGCTCTTGCACACTCAAGTCTCGATTCAGCAATTGCTTAAGCTGCCAGCGGAATGCTTTCATCCTAAACCAAAAGTAAACAGTGTCTTAATAAAACTTACCCGCCATACCACAGATGTTCCAGATAAATATTGGAAGCTATATACGTACTTTGTTTCAAAATGGGTCAATCGAGAATATCGTCAACTGTTTACTAAAAATCAGTTTCATCAAGCAATGAAACACGCCAAAGTAAACAATTTAAGTACCGTTACTTATGAGCAAGTATTGTCTATTTTTAATAGTTATCTATTATTTAACGGGAGGAAATAA
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7 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 fexA chloramphenicol 99.65 100.00 1428/1428 contig00026 4466 5893 AJ549214 ATGAAAAAGGATAGTAAATCTAAAGAAATGATTCAATCTGAAAAAAGGGGTTCTACTAGGCTTTTAATGATGGTACTCTCCCTATCTGTACTTGTAGGTTCAATTACGGCTGATTCAGTCAATCCCGTACTTCCACTAATAAGCAAAGCTTTAGAAGCTTCGAAATCTCAAGTGAGTTGGATAGTTAGTGGTATTGCACTTGTTCTTGCGATTGGAGTTCCGATTTATGGTCGAATCTCAGACTTTTTTGAGTTACGAAAGCTATATATCTTTGCCATTATGATTCTGGCAAGTGGTAGTCTTTTATGTGCAATTGCCCCGAACCTCCCATTGTTGGTTTTGGGAAGAATGGTTCAGGGTGCTGGGATGTCCGCAATTCCAGTTCTATCAGTCATTGCAATTTCGAAGGTTTTCCCACAAGGAAAACGTGGGGGAGCTTTGGGAATTATCGCAGGAAGTATTGGTGTTGGAACTGCTGCTGGTCCAATATTTGGTGGAGTAGTTGGTCAATATTTAGGGTGGAATGCCTTGTTTTGGTTCACATTTTTGTTAGCCATTATGATTGTTATTGGTGCCTACTACGCGTTACCGACAATTAAACCGGCAGAATCCGTAGGAAGCAATAAGAACTTTGATTTCATTGGTGGTTTATTCCTCGGCCTCACAGTAGGATTACTCCTTTTTGGCATCACTCAAGGAGAAACTTCTGGTTTTTCTTCGTTCTCATCGTTAACTAGCCTAATTGGTTCTGTTGTAGCTTTGGTGGGATTTATTTGGAGAATTGTTACCGCAGAAAATCCATTTGTACCACCTGTCCTGTTCAATAACAAGGATTATGTCAATACGGTCATAATTGCATTTTTTTCGATGTTTGCTTATTTCGCTGTTCTTGTGTTCGTCCCATTACTAGTCATTGAGGTGAATGGACTCTCTTCTGGACAGGCTGGAATGATATTGTTGCCAGGTGGTGTGGCTGTTGCAATCTTATCTCCCTTCGTTGGCCGTCTTTCTGATCGATTTGGGGATAAACGTCTGATAATTACTGGGATGACTCTGATGGGGCTGTCTACCTTATTCTTGTCCACCTATGCATCTGGTGCTTCACCTCTGTTAGTTTCCGTGGGGGTCCTCGGAGTAGGGATTGCTTTTGCATTCACGAATTCTCCCGCAAATAACGCCGCAGTAAGTGCACTCGATGCAGACAAGGTTGGTGTCGGAATGGGGATTTTCCAAGGTGCTTTGTACCTTGGAGCAGGAACTGGAGCAGGTATGATTGGAGCATTATTATCCGCTCGACGTGATGCTACTGAGCCGATAAATCCATTATATATATTGGACGCTATGTCCTACTCAGATGCGTTCCTTGCAGCTACAGGGGCAATACTCATTGCCTTAATAGCTGGATTAGGTTTAAAAAAGCGTGGGTAA
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8 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 lsa(A) lincomycin 100.00 100.00 1497/1497 contig00004 148769 147273 AY737526 ATGTCGAAAATTGAACTAAAACAACTATCTTTTGCCTATGATAATCAAGAAGCGTTGCTTTTTGATCAGGCAAATATCACGATGGATACCAATTGGAAATTAGGATTGATTGGCCGCAATGGCCGTGGGAAAACAACCTTATTAAGATTGTTACAAAAGCAGTTGGATTACCAAGGAGAGATTCTTCATCAAGTCGATTTCGTCTATTTTCCACAAACAGTTGCAGAAGAACAACAGCTCACTTATTATGTCTTACAAGAGGTGACTTCTTTTGAACAGTGGGAATTAGAACGAGAATTAACGCTTTTAAACGTTGATCCTGAAGTTTTATGGCGGCCCTTTTCTTCTTTATCAGGCGGCGAAAAGACGAAAGTTTTATTAGGTCTTCTTTTTATTGAAGAAAAGGCCTTTCCTTTAATTGACGAGCCAACAAATCATTTAGATCTAGCTGGCAGACAACAAGTGGCTGAATATTTGAAGAAAAAGAAACACGGGTTTATTTTAGTCAGCCACGATCGGGCATTTGTTGATGAAGTGGTTGATCATATTTTGGCGATTGAAAAAAGTCAATTGACGCTGTATCAAGGGAATTTTTCTATTTATGAAGAGCAAAAAAAATTAAGAGATGCTTTTGAACTAGCAGAAAATGAAAAAATCAAAAAAGAAGTCAATCGCTTGAAAGAAACCGCTCGTAAAAAAGCGGAATGGTCGATGAACCGTGAAGGTGATAAGTACGGCAATGCTAAAGAAAAAGGAAGCGGGGCGATTTTTGATACAGGAGCCATTGGTGCCCGGGCAACGCGCGTAATGAAGCGCTCGAAACACATTCAACAACGTGCCGAAACACAATTAGCAGAAAAAGAAAAACTATTAAAAGATCTTGAGTATATTGATCCTTTGTCAATGGATTATCAGCCAACGCATCACAAAACATTATTGACGGTGGAAGAGCTTCGTCTAGGCTACGAGAAAAATTGGCTGTTTGCGCCAATTTCTTTTTCAATAAACGCGGGAGAAATTGTTGGAATAACAGGAAAAAATGGCTCAGGAAAATCGAGCTTGATTCAGTATTTGTTGGGGGATTTTTCTGGAGATTCAGAAGGCGAAGCCACTTTGGCTCACCAATTAACCATTTCTTATGTGCGCCAAGATTATGAAGACAATCAAGGAACTTTATCCGAATTTGCAGAGAAAAATCAGTTAGATTACACCCAATTTTTAAATAACTTACGAAAACTTGGGATGGAGCGCGCCGTTTTCACTAATCGAATTGAACAAATGAGTATGGGGCAACGGAAAAAAGTCGAAGTAGCCAAATCATTGTCTCAATCAGCTGAACTTTATATTTGGGATGAACCCCTTAATTACTTGGATGTGTTTAATCATCAACAATTAGAAGCGCTAATCTTATCTGTGAAGCCTGCAATGCTAGTGATTGAGCATGATGCACATTTCATGAAGAAAATAACAGATAAAAAAATTGTCTTGAAATCATAA
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9 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 optrA linezolid, chloramphenicol 100.00 100.00 1968/1968 contig00026 6581 8548 KP399637 TTGTCCAAAGCCACCTTTGCAATTGCTAGTACTAACGCAAAGGAGGATATGAAAATGCAATACAAAATAATTAATGGTGCCGTTTACTATGATGGTAATATGGTGTTGGAAAACATCGGTATTGAAATCAATGATAATGAAAAGATTGCTATTGTTGGTAGAAATGGATGTGGAAAAACAACCTTGCTAAAAGCTATTATAGGCGAAATTGAATTAGAAGAAGGAACTGGTGAAAGTGAGTTTCAAGTAATAAAGACCGGTAACCCTTATATTAGCTATTTAAGACAGATGCCTTTTGAAGATGAAAGTATATCAATGGTGGATGAAGTCCGTACGGTATTTAAGACGCTTATTGATATGGAAAACAAGATGAAACAGCTGATAGATAAAATGGAGAATCAATATGATGATAAAATCATCAATGAATACTCTGATATCAGTGAAAGGTATATGGCTCTTGGAGGTCTAACCTACCAAAAAGAATATGAAACGATGATTCGTAGTATGGGTTTTACTGAAGCAGATTATAAAAAACCCATTTCTGAATTTTCAGGTGGTCAGCGAACTAAGATAGCTTTTATAAAAATACTTTTAACAAAGCCAGACATTCTATTACTTGATGAACCTACTAACCACCTTGATATAGAAACAATACAATGGTTGGAGAGTTATTTGAGAAGTTATAAATCTACATTGGTTATTATTTCCCATGATAGAATGTTTCTTAATCGAATTGTGGATAAGGTTTATGAAATCGAATGGGGAGAGACCAAATGTTATAAAGGTAATTATTCAGCCTTTGAGGAGCAAAAACGAGAAAATCATATCAAACAGCAAAAAGATTACGACTTGCAACAGATAGAAATTGAAAGGATTACACGCTTGATTGAACGTTTTCGTTATAAACCTACGAAAGCTAAAATGGTGCAATCTAAAATTAAATTATTACAGCGTATGCAAATATTAAATGCACCAGACCAATACGATACAAAAACTTATATGTCTAAATTTCAACCGAGAATCAGTAGTTCAAGGCAAGTATTAAGTGCTTCAGAACTTGTGATAGGCTATGATACTCCTCTTGCAAAGGTTAATTTCAACCTTGAAAGGGGACAGAAGCTTGGAATTGTTGGGAGTAATGGTATTGGTAAATCCACGTTGCTTAAAACACTTATGGGTGGTGTGGCAGCATTGTCTGGAGATTTTAAATTCGGATACAATGTTGAAATTAGCTATTTTGACCAACAGCTTGCTCAAATCAGTGGAGATGATACACTATTCGAAATTTTTCAAAGCGAATACCCTGAGCTAAATGACACAGAGGTCAGAACTGCTCTTGGCTCATTTCAGTTTAGTGGAGATGATGTTTTTAGACCGGTGTCCTCTTTGTCAGGTGGAGAAAAGGTTAGATTGACATTATGTAAATTATTATATAAACGTACTAATGTTTTAATCTTAGATGAACCGACAAACCACATGGATATTATTGGAAAAGAGAATTTAGAGAATATCTTATGCAGTTATCAAGGTACAATTATTTTTGTGTCACATGATAGATATTTTACTAATAAGATTGCTGACAGATTACTTGTTTTTGATAAGGATGGTGTAGAGTTTGTACAATCTACTTATGGTGAGTACGAGAAAAAAAGGATGAATTCTGAAAAGCCATTTAATAACATTAAAGTTGAGCAGAAAGTAGAGAAAAATAACACAGTAAAAGGCGATCGTAACTCCATTGAGAAGGAGAAGGTTAAGAAGGAGAAACGAATTGAAAAGCTTGAAGTGTTAATAAATCAATATGATGAAGAATTAGAAAGATTGAATAAAATCATTTCTGAACCAAACAATTCTTCTGATTATATAGTACTGACGGAAATACAAAAATCAATTGATGATGTTAAAAGGTGTCAGGGTAATTATTTTAATGAATGGGAACAGTTGATGAGAGAATTGGAAGTTATGTAA
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10 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 tet(L) tetracycline 100.00 100.00 1377/1377 contig00050 282 1658 M29725 GTGAATACATCCTATTCACAATCGAATTTACGACACAACCAAATTTTAATTTGGCTTTGCATTTTATCTTTTTTTAGCGTATTAAATGAAATGGTTTTGAACGTCTCATTACCTGATATTGCAAATGATTTTAATAAACCACCTGCGAGTACAAACTGGGTGAACACAGCCTTTATGTTAACCTTTTCCATTGGAACAGCTGTATATGGAAAGCTATCTGATCAATTAGGCATCAAAAGGTTACTCCTATTTGGAATTATAATAAATTGTTTCGGGTCGGTAATTGGGTTTGTTGGCCATTCTTTCTTTTCCTTACTTATTATGGCTCGTTTTATTCAAGGGGCTGGTGCAGCTGCATTTCCAGCACTCGTAATGGTTGTAGTTGCGCGCTATATTCCAAAGGAAAATAGGGGTAAAGCATTTGGTCTTATTGGATCGATAGTAGCCATGGGAGAAGGAGTCGGTCCAGCGATTGGTGGAATGATAGCCCATTATATTCATTGGTCCTATCTTCTACTCATTCCTATGATAACAATTATCACTGTTCCGTTTCTTATGAAATTATTAAAGAAAGAAGTAAGGATAAAAGGTCATTTTGATATCAAAGGAATTATACTAATGTCTGTAGGCATTGTATTTTTTATGTTGTTTACAACATCATATAGCATTTCTTTTCTTATCGTTAGCGTGCTGTCATTCCTGATATTTGTAAAACATATCAGGAAAGTAACAGATCCTTTTGTTGATCCCGGATTAGGGAAAAATATACCTTTTATGATTGGAGTTCTTTGTGGGGGAATTATATTTGGAACAGTAGCAGGGTTTGTCTCTATGGTTCCTTATATGATGAAAGATGTTCACCAGCTAAGTACTGCCGAAATCGGAAGTGTAATTATTTTCCCTGGAACAATGAGTGTCATTATTTTCGGCTACATTGGTGGGATACTTGTTGATAGAAGAGGTCCTTTATACGTGTTAAACATCGGAGTTACATTTCTTTCTGTTAGCTTTTTAACTGCTTCCTTTCTTTTAGAAACAACATCATGGTTCATGACAATTATAATCGTATTTGTTTTAGGTGGGCTTTCGTTCACCAAAACAGTTATATCAACAATTGTTTCAAGTAGCTTGAAACAGCAGGAAGCTGGTGCTGGAATGAGTTTGCTTAACTTTACCAGCTTTTTATCAGAGGGAACAGGTATTGCAATTGTAGGTGGTTTATTATCCATACCCTTACTTGATCAAAGGTTGTTACCTATGGAAGTTGATCAGTCAACTTATCTGTATAGTAATTTGTTATTACTTTTTTCAGGAATCATTGTCATTAGTTGGCTGGTTACCTTGAATGTATATAAACATTCTCAAAGGGATTTCTAA
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pimarin
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diff changeset
11 10_Enterococcus_faecalis_S17_L001 tet(M) tetracycline 98.12 100.00 1920/1920 contig00047 5912 3993 X90939 ATGAAAATTATTAATATTGGAGTTTTAGCTCATGTTGATGCGGGAAAAACTACCTTAACAGAAAGCTTATTATATAACAGTGGAGCGATTACAGAATTAGGAAGCGTGGACAAAGGTACAACGAGGACGGATAATACGCTTTTAGAACGTCAGAGAGGAATTACAATTCAGACAGGAATAACCTCTTTTCAGTGGGAAAATACGAAGGTGAACATCATAGACACGCCAGGACATATGGATTTCTTAGCAGAAGTATATCGTTCATTATCAGTTTTAGATGGGGCAATTCTACTGATTTCTGCAAAAGATGGCGTACAAGCACAAACTCGTATATTATTTCATGCACTTAGGAAAATGGGGATTCCCACAATCTTTTTTATCAATAAGATTGACCAAAATGGAATTGATTTATCAACGGTTTATCAGGATATTAAAGAGAAACTTTCTGCCGAAATTGTAATCAAACAGAAGGTAGAACTGTATCCTAATATGTGTGTGACGAACTTTACCGAATCTGAACAATGGGATACGGTAATAGAGGGAAACGATGACCTTTTAGAGAAATATATGTCCGGTAAATCATTAGAAGCATTGGAACTCGAACAAGAGGAAAGCATAAGATTTCAGAATTGTTCCCTGTTCCCTGTTTATCACGGAAGTGCAAAAAACAATATAGGGATTGATAACCTTATAGAAGTGATTACGAATAAATTTTATTCATCAACACATCGAGGTCAGTCTGAACTTTGCGGAAATGTTTTCAAAATTGAATATACAAAAAAAAGACAACGTCTTGCATATATACGTCTTTATAGTGGCGTACTGCATTTGCGAGATTCGGTTAGAATATCGGAAAAGGAAAAAATAAAAATTACAGAAATGTATACTTCAATAAATGGTGAATTATGTAAAATCGATAAGGCTTATTCCGGGGAAATTGTTATTTTGCAGAATGAGTTTTTGAAGTTAAATAGTGTTCTTGGAGATACAAAGCTATTGCCACAGAGAGAGAGAATTGAAAATCCCCTCCCTCTGCTGCAAACGACTGTTGAACCGAGCAAACCTCAACAAAGGGAAATGTTGCTTGATGCCCTTTTGGAAATCTCAGATAGTGATCCGCTTCTACGATATTACGTGGATTCTACGACACATGAAATTATACTTTCTTTCTTAGGGAAAGTACAAATGGAAGTGATTAGTGCACTGTTGCAAGAAAAGTATCATGTGGAGATAGAACTAAAAGAGCCTACAGTCATTTATATGGAGAGACCGTTAAAAAATGCAGAATATACCATTCACATCGAAGTGCCGCCAAATCCTTTCTGGGCTTCCATTGGTTTATCTGTATCACCGCTTCCATTAGGGAGCGGAGTGCAGTATGAGAGCTCGGTTTCTCTTGGATACTTAAATCAATCGTTTCAAAATGCAGTTATGGAGGGGATACGCTATGGCTGTGAACAAGGATTGTATGGTTGGAATGTGACGGACTGTAAAATCTGTTTTAAGTATGGCTTATACTATAGCCCTGTTAGTACCCCAGCAGATTTTCGGATGCTTGCTCCTATTGTATTGGAACAAGTCTTAAAAAAAGCTGGAACAGAATTGTTAGAGCCATATCTTAGTTTTAAAATTTATGCGCCACAGGAATATCTTTCACGAGCATACAACGATGCTCCTAAATATTGTGCGAACATCGTAGACACTCAATTGAAAAATAATGAGGTCATTCTTAGTGGAGAAATCCCTGCTCGGTGTATTCAAGAATATCGTAGTGATTTAACTTTCTTTACAAATGGACGTAGTGTTTGTTTAACAGAGTTAAAAGGGTACCATGTTACTACCGGTGAACCTGTTTGCCAGCCCCGTCGTCCAAATAGTCGGATAGATAAAGTACGATATATGTTCAATAAAATAACTTAG