| Previous changeset 8:3748f04eb047 (2015-12-23) Next changeset 10:0ad59792c65b (2016-01-21) |
|
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/fidelram/deepTools/tree/master/galaxy/wrapper/ commit b'a4965adc865b4c85b35ed205bc10821edc104f20' |
|
modified:
bamCompare.xml deepTools_macros.xml test-data/bamCompare_result2.bw test-data/bamCoverage_result1.bw test-data/bamCoverage_result2.bw test-data/bamCoverage_result3.bg test-data/bamCoverage_result4.bw test-data/bamPEFragmentSize_histogram_result1.png test-data/bigwigCompare_result1.bw test-data/computeMatrix_result1.gz test-data/computeMatrix_result2.gz test-data/computeMatrix_result3.gz test-data/plotCoverage_result1.png test-data/plotPCA_result1.png test-data/profiler_result2.png tool_dependencies.xml |
|
added:
static/images/QC_multiBamCoverage_humanSamples.png test-data/multiBamCoverage_regions.bed test-data/multiBamCoverage_result1.npz test-data/multiBamCoverage_result2.npz test-data/multiBigwigSummary_result1.npz test-data/multiBigwigSummary_result1.png test-data/plotFingerprint_result1.png test-data/plotFingerprint_result2.png test-data/plotFingerprint_result2.tabular |
|
removed:
static/images/QC_bamCorrelate_humanSamples.png test-data/bamCorrelate_regions.bed test-data/bamCorrelate_result1.npz test-data/bamCorrelate_result2.npz test-data/bamFingerprint_result1.png test-data/bamFingerprint_result2.png test-data/bamFingerprint_result2.tabular test-data/bigwigCorrelate_result1.npz test-data/bigwigCorrelate_result1.png |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a bamCompare.xml --- a/bamCompare.xml Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ b/bamCompare.xml Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| @@ -83,7 +83,7 @@ <param name="method" type="select" label="Method to use for scaling the largest sample to the smallest"> <option value="readCount" selected="true">read count</option> - <option value="SES">signal extraction scaling (SES), check the bamFingerprint plot before using it!</option> + <option value="SES">signal extraction scaling (SES), check with plotFingerprint before using it!</option> <option value="own">enter own scaling factors</option> </param> <when value="SES"> @@ -218,7 +218,7 @@ .. image:: $PATH_TO_IMAGES/norm_IGVsnapshot_indFiles.png -You can find more details on the bamCompare doc page: https://deeptools.readthedocs.org/en/release-1.6/content/tools/bamCompare.html +You can find more details on the bamCompare doc page: https://deeptools.readthedocs.org/en/master/content/tools/bamCompare.html **Output files**: |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a deepTools_macros.xml --- a/deepTools_macros.xml Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ b/deepTools_macros.xml Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| @@ -185,7 +185,7 @@ <xml name="distanceBetweenBins"> <param argument="--distanceBetweenBins" type="integer" value="0" min="0" label="Distance between bins" - help="By default, bamCorrelate considers consecutive bins of + help="By default, multiBamCoverage considers consecutive bins of the specified 'Bin size'. However, to reduce the computation time, a larger distance between bins can be given. Larger distances result in fewer bins being |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a static/images/QC_bamCorrelate_humanSamples.png |
| b |
| Binary file static/images/QC_bamCorrelate_humanSamples.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a static/images/QC_multiBamCoverage_humanSamples.png |
| b |
| Binary file static/images/QC_multiBamCoverage_humanSamples.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCompare_result2.bw |
| b |
| Binary file test-data/bamCompare_result2.bw has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCorrelate_regions.bed --- a/test-data/bamCorrelate_regions.bed Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,3 +0,0 @@ -chrM 1 10 -chrM 5 15 -chrM 10 20 |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCorrelate_result1.npz |
| b |
| Binary file test-data/bamCorrelate_result1.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCorrelate_result2.npz |
| b |
| Binary file test-data/bamCorrelate_result2.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCoverage_result1.bw |
| b |
| Binary file test-data/bamCoverage_result1.bw has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCoverage_result2.bw |
| b |
| Binary file test-data/bamCoverage_result2.bw has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCoverage_result3.bg --- a/test-data/bamCoverage_result3.bg Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ b/test-data/bamCoverage_result3.bg Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| @@ -5,4 +5,4 @@ chrM 220 230 7690304.31 chrM 230 240 6027535.81 chrM 240 250 3325537.00 -chrM 250 16569 623538.2 +chrM 250 260 623538.19 |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamCoverage_result4.bw |
| b |
| Binary file test-data/bamCoverage_result4.bw has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamFingerprint_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/bamFingerprint_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamFingerprint_result2.png |
| b |
| Binary file test-data/bamFingerprint_result2.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamFingerprint_result2.tabular --- a/test-data/bamFingerprint_result2.tabular Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b"@@ -1,16071 +0,0 @@\n-'bowtie2-test1.bam'\t'bowtie2-test1.bam'\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-35\t35\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-33\t33\n-27\t27\n-25\t25\n-24\t24\n-21\t21\n-20\t20\n-19\t19\n-19\t19\n-19\t19\n-17\t17\n-17\t17\n-15\t15\n-15\t15\n-15\t15\n-10\t10\n-6\t6\n-5\t5\n-5\t5\n-5\t5\n-5\t5\n-5\t5\n-5\t5\n-5\t5\n-3\t3\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0"..b'0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n-0\t0\n' |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bamPEFragmentSize_histogram_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/bamPEFragmentSize_histogram_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bigwigCompare_result1.bw |
| b |
| Binary file test-data/bigwigCompare_result1.bw has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bigwigCorrelate_result1.npz |
| b |
| Binary file test-data/bigwigCorrelate_result1.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/bigwigCorrelate_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/bigwigCorrelate_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/computeMatrix_result1.gz |
| b |
| Binary file test-data/computeMatrix_result1.gz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/computeMatrix_result2.gz |
| b |
| Binary file test-data/computeMatrix_result2.gz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/computeMatrix_result3.gz |
| b |
| Binary file test-data/computeMatrix_result3.gz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/multiBamCoverage_regions.bed --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/multiBamCoverage_regions.bed Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| @@ -0,0 +1,3 @@ +chrM 1 10 +chrM 5 15 +chrM 10 20 |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/multiBamCoverage_result1.npz |
| b |
| Binary file test-data/multiBamCoverage_result1.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/multiBamCoverage_result2.npz |
| b |
| Binary file test-data/multiBamCoverage_result2.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/multiBigwigSummary_result1.npz |
| b |
| Binary file test-data/multiBigwigSummary_result1.npz has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/multiBigwigSummary_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/multiBigwigSummary_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/plotCoverage_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/plotCoverage_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/plotFingerprint_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/plotFingerprint_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/plotFingerprint_result2.png |
| b |
| Binary file test-data/plotFingerprint_result2.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/plotFingerprint_result2.tabular --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/plotFingerprint_result2.tabular Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| b"@@ -0,0 +1,16071 @@\n+'bowtie2-test1.bam'\t'bowtie2-test1.bam'\n+68\t68\n+65\t65\n+61\t61\n+57\t57\n+43\t43\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+37\t37\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+35\t35\n+29\t29\n+27\t27\n+26\t26\n+22\t22\n+21\t21\n+20\t20\n+20\t20\n+19\t19\n+17\t17\n+17\t17\n+15\t15\n+15\t15\n+15\t15\n+10\t10\n+7\t7\n+7\t7\n+7\t7\n+7\t7\n+6\t6\n+5\t5\n+5\t5\n+5\t5\n+3\t3\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0"..b'0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n+0\t0\n' |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/plotPCA_result1.png |
| b |
| Binary file test-data/plotPCA_result1.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a test-data/profiler_result2.png |
| b |
| Binary file test-data/profiler_result2.png has changed |
| b |
| diff -r 3748f04eb047 -r 8df6d798634a tool_dependencies.xml --- a/tool_dependencies.xml Wed Dec 23 14:44:06 2015 -0500 +++ b/tool_dependencies.xml Tue Jan 19 10:09:24 2016 -0500 |
| b |
| @@ -4,6 +4,6 @@ <repository changeset_revision="a28e3c30828d" name="package_python_2_7_10" owner="iuc" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> </package> <package name="deepTools" version="2.0"> - <repository changeset_revision="bd40c0aa7d8e" name="package_python_2_7_deeptools_2_0" owner="iuc" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> + <repository changeset_revision="52381820a4de" name="package_python_2_7_deeptools_2_0" owner="iuc" toolshed="https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu" /> </package> </tool_dependency> |
