bigbed_to_fa_340: test-data/contigs.trf

comparison test-data/contigs.trf_4.nomask.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip

planemo upload

author	yating-l
date	Wed, 17 May 2017 16:49:32 -0400
parents
children

comparison

equal deleted inserted replaced

--1:000000000000
+:512ed6da2367
+>trf_1
+AATGATGCATTTAAATGCTGCATTTAAATG
+>trf_2
+ACAGACAGACGGACGAACAGACGGACGGACG
+>trf_3
+GAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTTGAGA
+AGTGCCGCCGAAGTG
+>trf_4
+GAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTCGAGA
+AGTGCCGCCGAAGTG
+>trf_5
+ATAATTTGTTTCATATTATTTCCCACCCAATTTTCGGATCGTTCCTATGA
+CAGCTATATGATATAGTCGTCAGATTTTGTAAAAGTTTAATTCAAAACCA
+AATAAAAAATGCTATTTCCAAGCGTAGAAGGTTATACGTTAAAAAACACC
+GAAGATATAATTTTTCCATATTATTTTGCCACTAATTTTCCGTTTGTTCC
+TATGGGAGCTATATGATATAGGTATCCGATTTTGATAAAATGTAATTCAA
+AATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCATGCTTAGAAAGCTATATG
+TTTAAAATAACCCAAAGATAATTTTTTCTTATTATTTTACCACTAATTTT
+TCGATCCTTCATATGGCAGCAATATGATATAGTCGTCCGATTTCGATAAA
+AATTGAATTCGAAATTCTGAACTAATTAAAAATGGTTATCTCCAAGCTTA
+GAAGGTTATATGTTAAAAA
+>trf_6
+AACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTCGTATCAAATTTTATTAAAATCGG
+CCGACTATATCATATAGCTCCCATAGCAACAATCGGAAAATTAGTGGTAA
+AATAATATTCAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTATAACCTCCT
+ACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTACGAATTACATTT
+TATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATGGTAA
+AATTAGTAGAAAAAACATGAAATAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTA
+ACATATAACTTGAAAGCTTAAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATT
+TAAATTTAAATTTTATTAAAATCGGAAGACCATATCATATAGCTGTCATA
+GGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAATAAT
+>trf_7
+ATATATATATATATATATATATTTATATATATATATATATATA
+>trf_8
+GCTGAGGATGAGCTACAGAGCTGAGGATGAGATACAG
+>trf_9
+ATATATATATATATATATATATTTATATATATATATATATATA
+>trf_10
+GCTGAGGATGAGCTACAGAGCTGAGGATGAGATACAG
+>trf_11
+TATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGT
+>trf_12
+CAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATA
+TAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCT
+ATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGT
+TTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAA
+AAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAAC
+A
+>trf_13
+TCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTT
+C
+>trf_14
+TTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTT
+CATATCATC
+>trf_15
+TTTTAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATACAGCTGCCAT
+TGAACGATCGGAAAATAAGTGGTCAAATAATATGAAAAACTTATATCTTC
+GGTGACTTTAACATATAACTTCCAATGCTTGGAAATACAATTTTTAATTG
+GTTTTCAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATATATA
+GCTGCCATAAATACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAATATAAAAAAATTAT
+ATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAACTTGAAAATAACATTT
+TTTAATTAGTTCTAAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGTTAACTA
+TATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATA
+>trf_16
+TATGTATAAACAATGTTCATACTTATGTGTAAACAATGTTCATACTTATG
+TGT
+>trf_17
+AATACAATACAATTTTTAATACAATACAATTTT
+>trf_18
+TATAATTTTGGGAATATAATATATTGGGAATATAATTTT
+>trf_19
+AATTATCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTT
+AATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAATTAATTAAAAAATGTTTTTTTTAA
+GCTTATAAGGTTATATGTTAAAAAACACTAAAGATATAATTTTAATTTAT
+GTTTTCCGACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGTTATATGATATAAT
+CGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAAT
+GTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTCATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAA
+TTTTTCAATATTATTCACCATTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTA
+TAAGATATAGTCGACCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACT
+AATTTAAAAGTGTTATATCCAAACTTAAAAAAGTATATCTTATAAAACAC
+GAAAGATAATAATTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTACTCGATAGTTCCTA
+TGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGAT
+>trf_20
+ACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACA

Mercurial > repos > yating-l > bigbed_to_fa_340

comparison test-data/contigs.trf_4.nomask.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip