--- a/test-data/illuminaPE_r1.fq	Thu Mar 19 05:57:37 2015 -0400
+++ b/test-data/illuminaPE_r1.fq	Fri Dec 04 04:36:51 2015 -0500
@@ -1,40 +1,40 @@
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:10979:1695#0/1
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:10979:1695 1:N:0:TCCTGA
 TACTGTTTAGAATAGACTGTTCTCCCACTATATTTTGCATTGGTGCATACTCAGCTTTAGTAATAAGTGTGATTCTGGTAGAGAGAGAGAGAGATACCAACCTCTTCTTCCCACTA
 +
-hhhhhghhhfgghhcfghhhhhhghhhhhhhhhhhhgfhhhhgfhhhhggghggfghhggdgghfgfcgcgggffgdf`gfcfdgdfdfafbdcaccfddecddbfcdfcdcdcdW
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:17449:1584#0/1
+IIIIIHIIIGHHIIDGHIIIIIIHIIIIIIIIIIIIHGIIIIHGIIIIHHHIHHGHIIHHEHHIGHGDHDHHHGGHEGAHGDGEHEGEGBGCEDBDDGEEFDEECGDEGDEDEDE8
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:17449:1584 1:N:0:TCCTGA
 TCGTAGCATGTGTATGCTTTGGGGTTTCATGCTGTTGATTCATAACTGCTGCTGGCTGTAGACTGAACCTTCTGGGTAGGAGGAATATGCTTAGACAAGCACACCAGTCAGCCCGA
 +
-hhhhhhhhhhghhhhhfhhhhehhhhhhfhhhhfahgahhhghhhhghhgggdgeggedegdedhbgdffcacaccM\^^[`_^^^aaaacaaa^_bddd_aaa_a[VQ^Z_BBBB
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:19063:1614#0/1
+IIIIIIIIIIHIIIIIGIIIIFIIIIIIGIIIIGBIHBIIIHIIIIHIIHHHEHFHHFEFHEFEICHEGGDBDBDD.=??<A@???BBBBDBBB?@CEEE@BBB@B<72?;@####
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:19063:1614 1:N:0:TCCTGA
 TATATATATATATACACATATATATATATATTTTTTACATTATTTCACTTCGCCCAAACTAGAGAGTCTAACAAAGTACAACCCAGCATATTAAAGTTCATCTCAGTTTTGTTCTG
 +
-hhhhhhhfhdhhhhfhhhgghghfhfhhhhhghhhhgfadhhhhghegghgehhhhegehghhgee]dddacfccZacWccaaccafgfggggded\cabcdddadadfgf`eg_d
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:1978:1220#0/1
+IIIIIIIGIEIIIIGIIIHHIHIGIGIIIIIHIIIIHGBEIIIIHIFHHIHFIIIIFHFIHIIHFF>EEEBDGDD;BD8DDBBDDBGHGHHHHEFE=DBCDEEEBEBEGHGAFH@E
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:1978:1220 1:N:0:TCCTGA
 TCATAAGAATGAGCAGTAAACAAAGGCAAAGGGGAGATAACACACACACACAAAATAAAAAAACATCAATTTCTAATACACGCCTTTATTATAAAGAAATAAATCACTGAAAAACA
 +
-cccccacaccaV^aaaTaa]P^[^WW]ccc^SGURUVZ]^Q[PUS\Z]W[Occc]]`U`^]ZZU]JU]][]SLWSWSWWWE_c__cc[cZc]]^[XccZUccb[ccZ[WW_BBBBB
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:5626:1554#0/1
+DDDDDBDBDDB7?BBB5BB>1?<?88>DDD?4(6367;>?2<164=;>8<0DDD>>A6A?>;;6>+6>><>4-8484888&@D@@DD<D;D>>?<9DD;6DDC<DD;<88@#####
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:5626:1554 1:N:0:TCCTGA
 TCTAATATTATATATATCTGTGTGTGTATATATATATATACACACACACACACACATTGCTATTGTTAAATTAACCACCTTTTTATTTATAATACTATTATAACACTTATCTGTAT
 +
-R[\[[Zaddbb`d`ada_aY_VUVXQPX[Y]\a\__^^`XZa____BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:5879:1238#0/1
+3<=<<;BEECCAEABEB@B:@7679219<:>=B=@@??A9;B@@@@######################################################################
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:5879:1238 1:N:0:TCCTGA
 TCCCCACCCTGTCATGGTTCTATGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGGTTTCCGTATTCCACATTAAAACCTTATGTAACGTACGGGCCAATAAATAGTTACTCGCCATATCC
 +
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:6204:1090#0/1
+####################################################################################################################
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:6204:1090 1:N:0:TCCTGA
 TGCTTTGGTTCTAAGAGAAAAACAATTATTATAAATGTTTATAATTGATGATAAGCATTTTTGTACAAAGCCAAGACCATTCTGAATGAAGCACCCAAAAAGCCCGGAGGCAACAA
 +
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8044:1926#0/1
+####################################################################################################################
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8044:1926 1:N:0:TCCTGA
 TAGATTTTTTTTTTTATATATATATAAATATAGATGTACATATATTTATATAAATATAAAAGCACAGCATCCTCCTGTCTCTCCTCCTGATTTATTATGGTTAAAGCTTGTGACAG
 +
-gggggggggggggggegefegdeeceXQ\_\]ZZZ\gggfggggggggggggggggfgggeggggegecggggggggggggggggfggffggggggggggdggggfdgggded]da
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8157:1636#0/1
+HHHHHHHHHHHHHHHFHFGFHEFFDF92=@=>;;;=HHHGHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHFHHHHFHFDHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGGHHHHHHHHHHEHHHHGEHHHEFE>EB
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8157:1636 1:N:0:TCCTGA
 TACTAGTCTAATAATTGCAGGCAGCTGAACTAGATAGGTCCTAAAGTACAGTGGGGAGGCTGGTGTGTGTGTGTGCATGGGATTGTCAGCCTTACCATCAGTCCTGATTTGTAGGT
 +
-gggggggggggggegggggfggggggfggggfgggggg]ggffffeeggggfgfggeggggffafcb`b]bacaccbefdc_acca_aaaadbbc_[bb]b\^X\\_bdba\aaaW
-@ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8899:1514#0/1
+HHHHHHHHHHHHHFHHHHHGHHHHHHGHHHHGHHHHHH>HHGGGGFFHHHHGHGHHFHHHHGGBGDCAC>CBDBDDCFGED@BDDB@BBBBECCD@<CC>C=?9==@CECB=BBB8
+@ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8899:1514 1:N:0:TCCTGA
 TCTTTATCTAAACACATCCTGAAATACCATCTGTTACACACACACACAGCAGTGGAAGTATAAAAAAAAATCTGGACATCTCAAAATAATTGCGTTTCTGAAGTGTTACATTTTTC
 +
-hhhhhghhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhfhhhhhfhhhhhhhhhhhhhhggfhhhhghgggghgggggggfgggggfegdgdggggggghh]
+IIIIIHIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIGIIIIIGIIIIIIIIIIIIIIHHGIIIIHIHHHHIHHHHHHHGHHHHHGFHEHEHHHHHHHII>