Mercurial > repos > peterjc > sample_seqs

comparison test-data/ecoli.pair_sample_N100.fastq @ 3:dc55e58fa890 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded v0.1.2, embeds citations, interleaved mode
author peterjc
date Fri, 21 Nov 2014 08:30:03 -0500
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
2:219924bd7e3e 3:dc55e58fa890
1 @frag_1
2 AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTC
3 +
4 ##%')+.024JMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
5 @frag_1_a
6 GAGACATATTGCCCGTTGCAGTCAGAATGAAAAGCT
7 +
8 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMJ420.+)'%##
9 @frag_200
10 TGGTAATGGTGATGGTGGTGGTAATGGTGGTGCTAA
11 +
12 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
13 @frag_201
14 TAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCAC
15 +
16 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
17 @frag_400
18 TGGCCACCTGCCCCTGCCTGGCATTGCTTTCCAGAA
19 +
20 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
21 @frag_401
22 TCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCAC
23 +
24 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
25 @frag_600
26 TTGGGCAAATTCCTGATCGACGAAAGTTTTCAATTG
27 +
28 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
29 @frag_601
30 AATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAA
31 +
32 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
33 @frag_800
34 ATATCGACGGTAGATTCGAGGTAATGCCCCACTGCC
35 +
36 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
37 @frag_801
38 GCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATT
39 +
40 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
41 @frag_1000
42 TATAGACCCCGTCAACGTCCGTCCAAATCTCGCAAC
43 +
44 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
45 @frag_1001
46 TTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATAC
47 +
48 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
49 @frag_1200
50 ATCACGGCTGGCACCAATGAGCGTACCTGGTGCTTG
51 +
52 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
53 @frag_1201
54 AAGCACCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATG
55 +
56 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
57 @frag_1400
58 CAGTCGCTTTGTGGAACGCAGAAACTGATGCTGTAT
59 +
60 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
61 @frag_1401
62 TACAGCATCAGTTTCTGCGTTCCACAAAGCGACTGT
63 +
64 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
65 @frag_1600
66 ATCCCTGAGCAATGGCGACAATGTTGATATTGGCGC
67 +
68 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
69 @frag_1601
70 CGCCAATATCAACATTGTCGCCATTGCTCAGGGATC
71 +
72 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
73 @frag_1800
74 GACACGTAAGTCGATATGTTTATTCTTCAGCCAGCT
75 +
76 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
77 @frag_1801
78 GCTGGCTGAAGAATAAACATATCGACTTACGTGTCT
79 +
80 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
81 @frag_2000
82 AAGTCGGCATATTGATCCGCCACTGCCTGGCTGGAA
83 +
84 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
85 @frag_2001
86 TCCAGCCAGGCAGTGGCGGATCAATATGCCGACTTC
87 +
88 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
89 @frag_2200
90 CGGAGAACTTCATCAATTCATCACCTGCATTGAGCA
91 +
92 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
93 @frag_2201
94 GCTCAATGCAGGTGATGAATTGATGAAGTTCTCCGG
95 +
96 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
97 @frag_2400
98 TTCAATATCCGCCAGCTCCAGTTCACGTCCCGTTTC
99 +
100 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
101 @frag_2401
102 AAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAA
103 +
104 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
105 @frag_2600
106 GGATCATTACCATCCACTTCGGCAATCTTCACGCGG
107 +
108 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
109 @frag_2601
110 CGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCG
111 +
112 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
113 @frag_2800
114 ATTGGCACTGGAAGCCGGGGCATAAACTTTAACCAT
115 +
116 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
117 @frag_2801
118 TGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATA
119 +
120 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
121 @frag_3000
122 TGCTTACCCAGTTCCTGGCAAAAACGCTCCCAGCAC
123 +
124 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
125 @frag_3001
126 TGCTGGGAGCGTTTTTGCCAGGAACTGGGTAAGCAA
127 +
128 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
129 @frag_3200
130 ACGGTGCCACGTTGTCGTAATGAATGCTGCCGGAGA
131 +
132 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
133 @frag_3201
134 CTCCGGCAGCATTCATTACGACAACGTGGCACCGTG
135 +
136 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
137 @frag_3400
138 GTGAATGAAGCCTGCCAGATGTCGCCCGTGCGCAAT
139 +
140 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
141 @frag_3401
142 TTGCGCACGGGCGACATCTGGCAGGCTTCATTCACG
143 +
144 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
145 @frag_3600
146 ACGCGCTGGGCGGTTTCCGGCTTGTCACACAGAGCG
147 +
148 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
149 @frag_3601
150 GCTCTGTGTGACAAGCCGGAAACCGCCCAGCGCGTT
151 +
152 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
153 @frag_3800
154 GGTCGTGCGGAAAAAACAGCCCCTGATTTTTGCCCA
155 +
156 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
157 @frag_3801
158 GGGCAAAAATCAGGGGCTGTTTTTTCCGCACGACCT
159 +
160 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
161 @frag_4000
162 CCCGTGGAACAATTCCAGACAACCGACATCGCTTTC
163 +
164 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
165 @frag_4001
166 AAAGCGATGTCGGTTGTCTGGAATTGTTCCACGGGC
167 +
168 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
169 @frag_4200
170 TTTTCTTGCAGTGGACTGATTTTGCCTCGTGGATAG
171 +
172 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
173 @frag_4201
174 TATCCACGAGGCAAAATCAGTCCACTGCAAGAAAAA
175 +
176 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
177 @frag_4400
178 GCGGCAGCTGCGCAACAGCTTCAAAGTAGTAGCAAA
179 +
180 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
181 @frag_4401
182 TTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCA
183 +
184 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
185 @frag_4600
186 CATCGCGTTGGATAACGTCGCCTGAGTCGCTTTGGG
187 +
188 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
189 @frag_4601
190 CCAAAGCGACTCAGGCGACGTTATCCAACGCGATGG
191 +
192 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
193 @frag_4800
194 CCTGGATTCAACTGATCACGCAGCGCACGATAAGCT
195 +
196 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
197 @frag_4801
198 GCTTATCGTGCGCTGCGTGATCAGTTGAATCCAGGC
199 +
200 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
201 @frag_5000
202 AGATAATGAATAGATTTTACTGATGATTCATCATCA
203 +
204 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
205 @frag_5001
206 GATGATGAATCATCAGTAAAATCTATTCATTATCTC
207 +
208 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMK