Mercurial > repos > jjohnson > gatk2
directory / @ 12:b40671bc73d5 draft
| name | size | permissions | 
|---|---|---|
|  README | 211 | -rw-r--r-- | 
|  base_recalibrator.xml | 36514 | -rw-r--r-- | 
|  depth_of_coverage.xml | 64587 | -rw-r--r-- | 
|  gatk2_annotations.txt.sample | 3080 | -rw-r--r-- | 
|  gatk2_sorted_picard_index.loc.sample | 1268 | -rw-r--r-- | 
|  gatk2_wrapper.py | 7024 | -rw-r--r-- | 
|  gatk_wrapper.py | 6613 | -rw-r--r-- | 
|  haplotype_caller.xml | 46297 | -rw-r--r-- | 
|  indel_realigner.xml | 32312 | -rw-r--r-- | 
|  print_reads.xml | 33911 | -rw-r--r-- | 
|  realigner_target_creator.xml | 27419 | -rw-r--r-- | 
|  reduce_reads.xml | 39991 | -rw-r--r-- | 
|  tool_data_table_conf.xml.sample | 496 | -rw-r--r-- | 
|  tool_dependencies.xml | 3941 | -rw-r--r-- | 
|  unified_genotyper.xml | 41115 | -rw-r--r-- | 
|  variant_annotator.xml | 32748 | -rw-r--r-- | 
|  variant_apply_recalibration.xml | 25239 | -rw-r--r-- | 
|  variant_combine.xml | 29338 | -rw-r--r-- | 
|  variant_eval.xml | 35400 | -rw-r--r-- | 
|  variant_filtration.xml | 28501 | -rw-r--r-- | 
|  variant_recalibrator.xml | 47972 | -rw-r--r-- | 
|  variant_select.xml | 35683 | -rw-r--r-- | 
|  variants_validate.xml | 24036 | -rw-r--r-- | 
