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comparison test-data/samtools_fastx-out3-3.fasta @ 0:8d4e157baaec draft

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author iuc
date Mon, 12 Mar 2018 12:07:24 -0400
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127 >chrV_479347_479873_3:0:0_3:0:0_4
128 ACCGTAGTTGTAGTAGTAAAGCTTTTATAAGTGTTGAAGAATGTTTCTGTGAAAATCTCATTGTCGATAGTTAGTTTAACGAATGCATAATCTAGTAGTCCTATGTTATCATGGGAAAGCCCTCTGGTAGAATGACCCCTTTGTCTTTGATGATAGTAATAATTCTCAAGGTCTTTAGTGTCTACCAATTTTGAAAAGAT
129 >chrV_482784_483296_3:1:0_7:0:0_0
130 GCTTGAACTAGCACTGGCCGTTGAAGATTTCCTGTTCTTAGACCAGAGAAGACCTTTCATTAGACTCCTGCTTCGTTAATTGTTTTTTTTGTGTCTATCCAGAAAAGGCACGATGACCGTGTGTTCTATTAAACTGAAACGTTTGCTTGTTTGTTCTGTTGGAAAAAATGGGACTGATCTGCAGTCTCCTAACCAAAGAG
131 >chrV_498912_499362_2:1:0_5:0:0_8
132 CGTAAGAAGGGCATACGCTAAGGAATATTGATATATGTTTTGATATATGGACGTGAAATGACTAATGAAGTCGTAGAGAGTTTGGGAACTGTTTCGAGGCACTGTTTCACTTCTAACATTCATTTTCATCCCCTTTGTAATAGCGTTTTCCATTTATCCAGTTTGCCTTTCCGATTTTCAAACGTACAGTGATGAAATGC
133 >chrVI_18396_18897_3:0:0_4:0:0_0
134 GCCTAAATTATACTTCATGCATTGGTTATAAAAAATCATGTTTTTTTACATCGGCTCTAAAAAGCGCAGAAGACTTAATCATAGTTTCATTGTACGTGTTATGCTCACTAGAGTATGTAAGGCCCTTTTCCGTTCCCACAACTTGAAATATTTATCCTGGGGGGGCGGCTGTAAAACGGTAAAATAATTCTCAAATAGGT
135 >chrVI_38233_38753_3:0:0_4:0:0_2
136 TGTTAATACCGGTTTGCAGAACGTTAGAAAAGTTAGGACAAAAAAATGGAAAAAGTACTGGCAGTACAAGGCAGGTATTCCTATCGGTTTGAAACGGTCTCAATTGGATGAATTCAAAAATAAATATATGAAAGATGTGTTGGCGCAAACGAGTGTTCCTACAAATTTTCACGAAATAACGAATACGGATGAAACAATAA
137 >chrVI_118934_119464_5:0:0_3:0:0_1
138 TTTTCAAGTTATCAAGCGTTATGTTTTGAAACATCTGTTCCGTTTTCAGTTTTTCAAAAAGATCGATATTCTCTTGAGAATTAGGAAGTTCTACGCTCAACCTCCCGTGGGCAGAAGAAAAACAAAAGCTACTACAATTGTGTTAGAATACAGTTCTAATATTATCAAATAAGTAGTATTCATGTTACTAGTATATTATC
139 >chrVI_184780_185293_1:1:0_8:0:0_3
140 AATTTGGCCGCCTATCCAGCAGTGGAGTTTCCTTCTGACAGTGTTAAACGTTTTACCACAACTGAAACATTCTTTAGAACTCTCGTCCTTGATCCAATATTCCTTTGAGAGGACACCATTGTTACTGGTCATGTCCTTCTTGCGGTTGTTATAAAATGCGAACAGGAAACTCTTGGACAGGTATGCGGTCAAGGAAGAAG
141 >chrVII_48887_49401_7:0:0_6:0:0_6
142 CTTCATCTTTTAAGTTGGGGAATCCTGTGGACTTTGCTCTAGATGATAACTACGATACGTTTTGGCAGAGCTATGGAGGGCAACCACACCAATATGACATTATGTTTAGTACGAGAATGGACATCTGTGTGATGGCAATATTCTTTTCGATGATTGCGGACGAGTCCTATGCTCCAAGCTTAGTGAAAGTTAACGCGGGG
143 >chrVII_79245_79829_5:0:0_0:0:0_10
144 CTTTACTACAGTGGGTAAAACTATACAATTTACTAAACACGGAGTTTTCCTCGAAGTGGGACGATGATTTACTTTCTATATTCAATGAATCCCTATTCGAGACACTATTTAACGATAACGTTCAAGCGTTACTGATATCAAGTGCCAACAGCAAAGATCATCAATATCACTCCAATCAGCAATATAAGGACGCGATTGTT
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146 AAATAAGATCCAACGAGTCTACTCAAAGACTGCTGATTTCTGATTATTTTGGTCTTTATTTCTTTAGCACGATTTTCATATTTCAAAGTATTCAATGTCTCATCATAATGTGAACTGCTGGGCGATATGCAAACAATCATGACTGTTTAGCAATTGCCACCCAGTGCAAATTTCAACAGCCTAGTTAACTTGGAATCCCT
147 >chrVII_131596_132048_5:0:0_4:0:0_8
148 GGTGTCTAAAAGATTTCCGTTTTTGCAAGATATATCACAATTAGTTCGTGAAGAAACATTGGAAAAACCTCAATTATCTGAAATTGCTTTCGTTTTATTGAATACCTTCACGATTTACGAAGACAATAGGTCTAAAAGTTTGGTAACTTCAATATTGCTTGACATCTTAAATCTAGAGCGATGTCTCCTAGAAAACTTTA
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150 AAGAAGAAGAGTTCTTGTAGGCCAGGTTTAAGAATGGCAAGAGAGAAAAAAAGCATGATCACAAGAAAACTGATTTCAGAATTGTAATATCGGACGGCAATACTAGTGTAATCTGAACCACAAGGTTAGTCTAAGCTGGGTAAACCACCTGGCGAAAGACGAAAAAAAATAAGGAATCTGGATGATTATAACCTTTTTTA
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152 CCGTTCCAACAGTGCCAATGTTTCATCCCCAGAAAGTGAAAAGAATAAACGTCAAAGTAAATCATCGGGTAAAAGTAACACCTCAAACGATGCTTCTAACCAAAAAGCAACCAAGAAAAAAAGAAATCCAACCGAAGTAAATGATTCTGAGAATAATTCTTCGGAAGAAGACAAGAAGAAGGGTCAAAATGTCACATCAG
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154 TTGCCCGTACATATTAGGATTGGAAACGTACAATGTACTGAATTTCGTCAAGTACAATAAATTTGACCTGAAAACATTGCATAGGGTTTCATAATCTTTTTCACCCCGCGTATTTAGTTGCACAGTTAAAGTCAGTGCACCAAAGTACTTGACATTCGCATAGTACTTGTCATCAGATAAAAGCTCCTTAGCTAGGTGGA
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156 CATTGAACGACATAACCTATAGATCTAACCAATTTAGTTCTAGTGAACTGTGAAACATTGGAGTCTGGCATAATGACTGTGTTTAAAAAGCTTATAAAATGCATCAAATATGGAGTCAACTCCTCACGGCATGTCTCACATAATGTTGAAACAGTCTTGATAACCATACCTTCAAGTTTATCGTTCGAAATTTTTTCTTG
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158 TACATGTTTTGTGTTCAGCCTAAAAAAACGGATTTCATTGACTCTGACGGTAAAATTGTCACAGCTTATCGTAGTAACAATTTCACCAAAATATGGTATTTCTTGCTGGGTAAAAAAATTGGTGAAACAGAAAGATTCAGCTCAGATTCCCCCATCGGCAGCAATAATATTGAGAATTTTGGTGATATCGATCCAGAAGA
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160 TTCGCCAACATGGTTTTACCACATCCTGGTGGCCCATATAGCAAGACACCGCTAGGTGCTTGAAGTAAAGGGCTATTAGAATATACTTCTGGGATCATCAAGGGATATATGACACTTACATGTAGATCTGAAATAAGCGGGTCAAAGCCACCAATATCCTGGAATGTAATATTAATTTCATCTGGCGTAACGATAGAAGA
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162 TGACGGACGAATTCATGGTAGGTGAAGAAGGTGCTTTAGCAGACTGATCGGCAGCAACAGTTTTAACATTTTGGTTATTGACCATCACCATAGGTACAACGGGAGCGTTCGCTGTAATTGAATTACCTGCAGATGTACTTCTCATCGCTGTGACATTAACACTTGAACTTGAAGTTCTTGATAAAGGTTGCATTTGTAAA
163 >chrVII_892310_892899_5:0:0_6:0:0_5
164 ACGATCTCAGCTTAGTTATAGCTTACTGCCGTCCATACCTGAGTATTTGGTTGATGACGTGGATCATATTAAATATTTCTGCTTCATTCTACCCAATGGTTTTGCACAACGAATTTTACAGGTACGGCTACATAATGCCAATCCATAATGCCGTGGATAACTCTAAAGTGCTTTTTTTGAATTTAACCAAAAGAAAAATG
165 >chrVII_902032_902576_3:0:0_3:0:0_4
166 GATGATCCTCAGATGCAGATACCATAAAATCTGAATCTGGGACAAATCTGACACAAGTCACTTCAGCTTCGTGGCCTTACAAAGTTGCATAAACACCTTTATTATTTGGTTCAATGGGGTCCCATAATGCAATAGTTTTACCTGGGCCAAATTCGACGATTTTTTTAACTTTGTGTATATCGCTAACCTGAGTTTGCTTG
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168 TATAAGTAAAGTAGCGTTTTCTTGCTTCAGCTATTTGTTGTTTTATTTTTGATTTTGTATGTACATGAAATGAGTTTCTACATAATGAATATTTTTTTTAGTAAGGGTGCTCCAATCATTTTTTTTTCTTCCCCTTGCCCTTTGCAGTTGCAGCTGCATCCTTCTTCATCTTCTTAGGAGCACCTTTACCACGACGTTTC
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172 ATGTTGTTTTATCGAACAAGATTTATGCTGCTATTGTTTCTCCTTTCTTTTTTTCGCTTCTTCTTGCAGAAGGAACACGCAGATCTTAAACTGTTTCTGAGAAATATCCCTTCTGGCATTGTGATACGACATTAAAAAGGAATAAATATAATTGTGGCGGCTAATTTTCTTCATTCAGTAACTCAAATTGGTCTTTCAGT
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176 AAGACAGATGCTTTCTTGACTTATATTTTTATAATTATTGGAATTGCCGCTTTAACTAGTAAAGAATGAGATGGTGGCCGTATTCTGCTGCCCTACATTTAATATATATTCTAAAAGGTCTGTTAATTTTGTACAACTCCTTGGCGAGAAGGAGAGGTGGCAAAATATTTGTGAAAATGGGACCCAATTTAATCAAATAG
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182 GTAAACACCTAGCTTTTACGTCCCCTCCACAGTGAACTCAGAGCTTCCACCACCGCGATCTGTGAATGAGTAGGACCTCCGCTGTATTTCTAATGCAACGGCCTCGTCCTTGTCAGTCTGCGCAGCATATGTTTGTAACGGAAATGTGTCAAATATCCGTTTTACTGGCATGGTAACACTGAATGAACTTACCCTTGTGC
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184 GTCTGTCGTTGGATAACGGCGAAATCTTCCTTTGTCGTTCTTATATGGAAGTGAAGAGCTTGAGGATAACTTTTAGCAATTCTGATTAAGATATGACGAACCATATTGGCCTCCTTATGTGATAGAGAGGTTACTAGTTGACGAATGAAAGTAATCCAGTACCAAACGGGTATTTCGCCTCTAAAGGAGTCAAATGCGTT
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186 CATATCTGCTTGTTACATTTCTACGGGCGACTTAGAGAAGGTTATAGAGTTCACTACAAAGGCACTTGAGATAAAACCTGACCAATCTAAAGGCTTGCTGAGACGTGCATCTGCCAACGAGTCACTGGGCAACTTCACTGATGCTATGTTTGATCTATCTGTTTTGTCATTGAATGGTGCCTTTGATGGAGCCTCCATTG
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194 AAAGAGAGTCTACATCTTCACATAAGAAAGTGAAATTCGTTGAAGAAACAACCGTGGATAATGGCGAAGAATTGATTGTCCAAAAAGCTGTAAGCCAAACTAAGGAAGAAGAGAAGCCAATGGAGGACAGTGAAGATGAAGAACAGGAGGAGTTTGACATTCCCGCTATCGAATTAAGTGATGACGAAGAGGAGGAGGAA
195 >chrX_20624_21148_5:0:0_6:0:0_6
196 CATTGAGAGGTTTGGACTCCGTACGTGTCTATTGTGGGGTGCTGCTTCTATGCTATGCTGCTTTGCTGTGTTTGCCTCCGTCGGTGTGACAAAGAAGTGGCCTCAAGGCAGCAGTCACCAAGACATTACTTCTCAGGGCGCCGGTAACTGTATGCTTGTGTTTACTATGTTCTTCATTTTTTCGTTCGCCACCACTTGGG
197 >chrX_32511_32973_6:0:0_10:0:0_7
198 TCTCATGTGTCGTTTGAACTTTCCCTCTAATACGAAACTCTTGCGATTGATAACCATATATAGGACCCACTACATCTGAACCAAAACACATTTTAACTTTTATTTTGTGGGCAATTTTCATTGCATCAATTCCTTTGTAAAGCACCTCTGTATTTTTTCTACTATTTTCAGGTCCCAAGCAAGCACTAAATTGATCAGAA
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200 AAAAACTCAAATATTTAGGACGCGCGATTACCAGCGGCATGTTTACTCGCTGGAAGATGTGAAATAATTCTTGAATATGGGTTTGCAGTTAGACAATTTCAATCTAAATAATCTTAATCGACTATTCAATTCTTAAATTGTAAGGTTTTTTAATGGCCTTTCAGTTCTAGTATTTTTTATAAAACAAGACCAACATACAT
201 >chrX_131958_132464_9:0:0_5:0:0_0
202 GAATGGCACATTGTAAATTCAGTTTCAGAAACAGATCTGTGCCTGAGATGTTGCAAGAATTAAAGCTATCATTGATACACCGAGAAACAAATTTAAACATTTGCTTTAAAAGATTGGAATAATGGGAAAGTAACGTCATGTTATCGGGTCTTTTTTTCAAAATGTACTCTTGTATCATACTGCAATTCCTCATCAGTTTC
203 >chrX_185042_185518_4:0:0_1:0:0_b
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237 >chrXI_609225_609808_8:1:0_2:0:0_2
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239 >chrXI_628737_629238_4:0:0_5:1:0_a
240 CATCGAACTCTATTATTGGAGATTTATGCGATGACTACGATAAATTAAGCCTTTCTGAACTATTAGAATTATTCAATGAAGGCGAAGAATTACCAGAAATTTTGGGCTGTTGGGGAACATTGTGGTTTGCCACAATTTGCGAAAAGAATACGCATTCGATTAGTAGTGAAGATAAATTTCAAGAAATCGGTATACAAGAT
241 >chrXII_14440_14929_3:0:0_4:0:0_0
242 CGATGTAACGCATCTCATCTCTTTTAAACATAAAAGTCATTTGTGTAATGTAGAGATTTACAAAGATTTTAAAAAAATAACAAAACTATCCAAAACTATCTATATTTGAATACTTCCTCCTATTTTTTTTTTTTTAACTATAATGAATGAATGCATGCCATATTGACTTACGTAACAAGGTGGCCTATTGGTAATATATT
243 >chrXII_79515_79982_3:0:0_9:0:0_e
244 ATGATCATGGAAGTAATGCATAACACCGTTATCGACATTATCTAAGTCCCACACATTGAGTGATTCTAGTGGGAAACTATCGTTGGAAAGGAACGGATGGAACAGAGCCATCCATGTATCATCTCCGGCAAATTTGACAGTCTTATTTGCCCAATGGAGCTGTTTAAGAAAGTTATCCTCTTCGATTACTGTTCCATCGA
245 >chrXII_179129_179604_4:0:0_3:0:0_c
246 TGAAGATTCAGGCGGGCCAATTGGGCCTGGACGATAATGACGTGCCGGGCCCATTGCCGGACACAGACAGCAAACCCTCATCACAATCACAAAATGACACAGCAATGTTTAAATTGTGCAACTTTGAAAGTCCTGTGCTCAAGGAGCTATCACGGCGAACGGTAAACAAGGAAATGGAGACGCAGAGAATTATGACAAAC
247 >chrXII_224837_225269_7:1:0_1:0:1_7
248 ATGATTAGCAGAGATATACAAATATTTTAGTAAGAATACCATAAAGTATCTTTGCTTTCACAAATAGGAACAAGCACATAAATACAGTATAATAGACATGGCTGATCAAGAAAACTCTCCACTACATACAGTTGGTTTCGATGCTAGATTTCCCCAACAAAACCAAACAAAGCATTGTTTGCAATCTTATGTGGATTATC
249 >chrXII_329567_330050_4:0:0_5:0:0_3
250 AAGAAGAAAAAAAATGAAGGACGAAAAGAAAAGGCTCGAAGAGCTTGCAAAGAAAAGGGAACTAACCGAGTCTGTCTCACCTCCAGTGTTTAAAAATGCATTTGCAAACATGTCAAGTAGCACAACGCCTATTATCGCCGCTTACGAAAAAACAAATCCAGCCATCACTCCAGCACCTAATGTAAAAGCCGCTCACCCCA
251 >chrXII_343172_343673_10:0:0_4:1:0_9
252 CAATTTTACCACACCGCTACGGAAAAGGTCGACAAGGGTAATAAATGATGATTCGATGCCCCTAACAGGCGAAGTACTAGAGGAGAGGACAGCAGATGATCTCTATGGGATACATATGGACGTAGACGAAGTCGACTATCTGAATACATTGAGCCACATCGAGGAAGAAAAGCAATACGATTATTCAGCGTTTTGTGAGC
253 >chrXII_349489_350011_4:0:0_4:0:0_6
254 AGAAAGAGTGAGGAAGATTTTGAGAACGAACTTTCAAATGAACACTTCTCGGCTGATCAAGAGGATGACAGTGAAATACAATCTTTAATTGAAAACATTGAGGATAATCCACCTGATGCAAGTGCTAGTTTGACACCGGAAAGATCGTTAGAAGAATCGCGTGAATTGTGGCATCAAAGTGACATTTCGACCGCCGAATT
255 >chrXII_394208_394614_2:0:0_5:0:0_b
256 CACTCCAATGAACAGTATCCGAAGGTTCGGCACTACATAGTTTCTTTTATTAAGACCAATAAATAAGCTTTTTTGTATGCACTTTTTATTCGCTCATGCATAATTGATATAGCTGACTGAATGTCAGTAGTAATATCTGCGAGAAAATATGACACTAATTCTTGAGGTTTGTTGATTTACGTAATATGGTCCTCGTATAG
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258 TGTTGTTAATTCTATCATTTCTTTGATCACTGACTGGAAGCCCATTAGCGGCCCAGTCCGGTTTAGGAATATCTTCAGGGACATACCTTCTTGGGGTAAGTGGATATGAAGCCTTGACTTTACCAGAATATTTGAATTTTGGGACAGGAACATAAGCACCTTCCAAGCCGTCCTAAGCATTGTGCAAAGCTTTGTGAGCT
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374 AACATTAAAAACAAATTTTTAGAAAAACAAAAGCTGAATTAAAGACTAAATATTACACAATTTCTTCATACATTTCCGCCCCAAAGTCAAACAGCCTAAATAATATAAAAATTAACTTTTGGCAGCTCCAACCTCTGTACTGCCATCTAAAACTTTTCCAGTAAACGGCTTATATACAGTTAACAACCCGTCACTATCAA
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380 GAGGAATGTTTTGGTTTGGTATATGAGGAATGTGATGATGCGTAGGGGTAGTTGTGGACAATCGATTGTTCCTGGTGTGAGACAGTGGTTTGACAATATAAGTTGTTCCCATCTGCTTTAGCTGCTGGTACTGATCCAGTTGAAAATCTTGCAGAGAAGGTAATAGAGGGGGAGGAAAATATTGATTTGAATTGTTGATA
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382 CTAAGTTGCCAACTTACACCGCCAAGGACTCTGCCGTGGCCACTAGAAAATTATCAGAAACTGTTCTTGAGGATGTTTACAATCAATTGCCAGAGTTGATTGGTGGTTCTGCCGATTTAACACCTTCTAACTTGACCAGATGGAAGGAAGGCCTTGACTACCAACCTCCTTCTTCCGGTTCAGGTAACTACTCTGGTAGA
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384 TCTCGAGTATTTTTCACTTTTAGTATATAAGTAAAACATAAAAAACATGAGAGGTGGTATGGTTTATTTGCCGTCACTGTGGAGCCTTCAAGTAATGTAAATAAGAGGGAAAGTGTGATAGTACAAGATGAGTTCGAATTCAACACCAGAAAATGTTACTGCAGCACACGTTCTGTGGTATATTCCCAATAAGATCGGTT
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388 TTACTTCCTTACAATGTTTCAACCAGCAAGAAAATCCCGTTTACCCTGAATTGCTGGCCCCCTTTTATGAAAATTCATCCTATAATAAGAACGCGCCAATGGTAGAAATATTTTGGATCCTGGGGCCATCAGTTGGAGGTATTTCAGATCTGGAAGATTTGATTGTTTCTCTACATCCATTGATTTTCAAGATGGATCAC
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390 ACAGTTCGCTCTGAAATCTCCCCCTGGGTTTCCCAATGGAATGAAACGTTGGAAAAAGAACTATCCGACCCTCGATCTAATTTGACTAGACATATTAGGATGAATTTCGAAACCTTTAGGTCATTACCTACATTGAAAAATAGCATAATTCCATTAGTAGCGACATCCAAAAATTTTGGTTCACTGTGCACTGCCATAAA
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396 ATAACCATTTAGCGTGGAAAGGACTTTTTCTCTTATTTAGAACCACTGAGGTTGTCCCAGACATACTTTCGTATGATGAATATTTTGACCTGTGTGGCCAATATGCAGACGCACTTTAAAAGCCGGAACAGTCTCAAGTAGAACTAATAAATGACAAAAAATTACTACAGCAAACGCATCCATATTGTCAAAAAGCCTTT