Mercurial > repos > iuc > salsa

diff test-data/test.fasta @ 0:18bd1bf98498 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/salsa2 commit 67cd735c6709a56ad1c4d65cd84e38fccd59603b"
author iuc
date Sun, 17 Jan 2021 13:23:26 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test.fasta	Sun Jan 17 13:23:26 2021 +0000
@@ -0,0 +1,100 @@
+>HiC_scaffold_1
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGT
+GCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACA
+CTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGA
+CGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGC
+CATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCAC
+TGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCTGGCATTGTAGGTACCAGACACTAACAAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCTCGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTGCCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT