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comparison test-data/testpyGT.sh @ 9:42ac675e0c60 draft

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"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/pygenometracks commit d1b394c8e588a78d1b94e3e57922f7ce684ac835"
author iuc
date Wed, 18 Nov 2020 21:32:48 +0000
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children 2f09a07c94ab
comparison
equal deleted inserted replaced
8:345d24273a58 9:42ac675e0c60
1 . <(planemo conda_env pyGenomeTracks.xml) 1 . <(planemo conda_env pyGenomeTracks.xml)
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3 # pgt --tracks test-data/test2.ini --region chrX:3000000-3500000 -o test-data/bigwig_multiple.png 3 pgt --tracks test-data/test2.ini --region chrX:3000000-3500000 --fontSize 12 -o test-data/bigwig_multiple.png
4 # pgt --tracks test-data/test3.ini --region chrX:3000000-3500000 -o test-data/master_TADs_BW_plot.png 4 pgt --tracks test-data/test3.ini --region chrX:3000000-3500000 --fontSize 12 -o test-data/master_TADs_BW_plot.png
5 # pgt --tracks test-data/test4.ini --region X:2700000-3100000 -o test-data/test_alpha.png 5 pgt --tracks test-data/test4.ini --region X:2700000-3100000 --fontSize 12 -o test-data/test_alpha.png
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12 # pgt --tracks test-data/test11.ini --region chrX:3250000-3400000 -o test-data/test_TADs_bdgm.png 12 pgt --tracks test-data/test11.ini --region chrX:3250000-3400000 --fontSize 12 -o test-data/test_TADs_bdgm.png
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14 # pgt --tracks test-data/test13.ini --region chrX:3000000-3300000 -o test-data/test_link2.png 14 pgt --tracks test-data/test13.ini --region chrX:3000000-3300000 --fontSize 12 -o test-data/test_link2.png
15 # pgt --tracks test-data/test14.ini --region chrX:3000000-3300000 --title "Scale bar" --trackLabelFraction 0.5 --trackLabelHAlign center -o test-data/test_scale_bar.png 15 pgt --tracks test-data/test14.ini --region chrX:3000000-3300000 --fontSize 12 --title "Scale bar" --trackLabelFraction 0.5 --trackLabelHAlign center -o test-data/test_scale_bar.png
16 # pgt --tracks test-data/test15.ini --region chrX:3300000-3500000 -o test-data/test_tssarrow.png 16 pgt --tracks test-data/test15.ini --region chrX:3300000-3500000 --fontSize 12 -o test-data/test_tssarrow.png
17 # pgt --tracks test-data/test4.ini --region chrX:2700000-3100000 --decreasingXAxis -o test-data/test_alpha_dec.png 17 pgt --tracks test-data/test4.ini --region chrX:2700000-3100000 --fontSize 12 --decreasingXAxis -o test-data/test_alpha_dec.png
18 # pgt --tracks test-data/test17.ini --region chr2:73,800,000-75,744,000 -o test-data/test_log.png 18 pgt --tracks test-data/test17.ini --region chr2:73,800,000-75,744,000 --fontSize 12 -o test-data/test_log.png
19 # pgt --tracks test-data/test18.ini --region chrX:2700000-3100000 -o test-data/test_operation.png 19 pgt --tracks test-data/test18.ini --region chrX:2700000-3100000 --fontSize 12 -o test-data/test_operation.png
20 # pgt --tracks test-data/test19.ini --region chr2:73,800,000-75,744,000 -o test-data/test_log_grid.png 20 pgt --tracks test-data/test19.ini --region chr2:73,800,000-75,744,000 --fontSize 12 -o test-data/test_log_grid.png
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