Mercurial > repos > iuc > kc_align
comparison test-data/kc-align.fasta @ 1:a98a0137c1e7 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/kc-align commit e87ad1b9f89ab8a1ccd5405de86d8e99901844c7"
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| date | Fri, 27 Mar 2020 18:59:48 +0000 |
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| 129 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | 129 TGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGTGGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGAC |
| 130 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | 130 TCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACA |
| 131 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | 131 >MN996528.1 |
| 132 CATTACACATAA | 132 ATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTACAACC |
| 133 > AY394996.1 SARS coronavirus ZS-B, complete genome | 133 AGAACTCAATTACCCCCTGCATACACTAATTCTTTCACACGTGGTGTTTATTACCCTGAC |
| 134 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | 134 AAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCC |
| 135 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | 135 AATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTGAT |
| 136 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | 136 AACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTTGCTTCCACTGAGAAGTCTAACATA |
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| 138 ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT | 138 AATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAATTTCAATTTTGTAATGATCCATTT |
| 139 GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC | 139 TTGGGTGTTTATTACCACAAAAACAACAAAAGTTGGATGGAAAGTGAGTTCAGAGTTTAT |
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| 141 TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT | 141 GGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTTGTGTTTAAGAATATTGATGGTTAT |
| 142 ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT | 142 TTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTCAGGGTTTT |
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| 145 GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT | 145 GGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATAAT |
| 146 ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- | 146 GAAAATGGAACCATTACAGATGCTGTAGACTGTGCACTTGACCCTCTCTCAGAAACAAAG |
| 147 ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA | 147 TGTACGTTGAAATCCTTCACTGTAGAAAAAGGAATCTATCAAACTTCTAACTTTAGAGTC |
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| 152 TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC | 152 GTAATTAGAGGTGATGAAGTCAGACAAATCGCTCCAGGGCAAACTGGAAAGATTGCTGAT |
| 153 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | 153 TATAATTATAAATTACCAGATGATTTTACAGGCTGCGTTATAGCTTGGAATTCTAACAAT |
| 154 TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA | 154 CTTGATTCTAAGGTTGGTGGTAATTATAATTACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAAT |
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| 156 GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT | 156 AATGGTGTTGAAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT |
| 157 TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT | 157 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACTTCTACATGCA |
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| 199 > MG772934.1 Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZXC21, complete genome | 199 AAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCC |
| 200 ATG---TTGTTTTTCTTGTTTCTTCAGTTCGCCTTAGTAAACTCCCAGTGT---GATTTG | 200 AATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTGAT |
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| 220 TGTTTTACGAGTGTGTATGCTGATACATTTCTCATAAGATTTTCAGAGGTCAGACAAGTG | 220 CTCAAACCTTTTGAGAGAGATATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGT |
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| 225 ACACTTAGTACTTATGACTTTAACCCTAATGTACCGCTTGAATATCAAGCTACAAGGGTT | 225 CCTTTCCAACAATTTGGCAGAGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAG |
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| 242 GCTGGTTTTATAAAACAGTACGGTGATTGTTTGGGTGATATTTCTGCTAGAGATTTGATT | 242 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTATGAGAACCAA |
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| 250 GTTCAGATTGATAGGTTGATCACAGGTAGACTTCAGAGTTTACAGACGTATGTGACTCAA | 250 GTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCC |
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| 262 ACAATCCTGCTTTGTTGCATGACAAGTTGTTGCAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGC | |
| 263 GGATTTTGCTGTAAATTTGATGAAGATGACTCTGAGCCTGTGCTCAAAGGAGTCAAATTA | |
| 264 CATTACACGTAA | |
| 265 > AY304488.1 SARS coronavirus SZ16, complete genome | |
| 266 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
| 267 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
| 268 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
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| 270 ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT | |
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| 330 CATTACACATAA | |
| 331 > EU371564.1 SARS coronavirus BJ182-12, complete genome | |
| 332 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
| 333 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
| 334 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
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| 397 > MK211376.1 Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B, complete genome | |
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| 462 CATTACACATAA | |
| 463 > KY417146.1 Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231, complete genome | |
| 464 ATG---TTTATTTTCTTATTCTTT---CTCACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
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| 661 > AY394985.1 SARS coronavirus HSZ-Bb, complete genome | |
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| 735 TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT | |
| 736 ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT | |
| 737 GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT | |
| 738 GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA | |
| 739 GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCCATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT | |
| 740 ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- | |
| 741 ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA | |
| 742 AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
| 743 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
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