view test-data/examples/simulation/SvmMSim.model @ 18:6daaa75ccb99 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproteomics/tools-galaxyp/tree/master/tools/openms commit 6e7368b7f178fbd1f08c28eea1b538add6943a65-dirty"
author galaxyp
date Sun, 13 Dec 2020 15:03:50 +0000
parents
children
line wrap: on
line source

<PrecursorCharge>
2
</PrecursorCharge>
<PrimaryTypes>
<IonType>
8

1
<SvmModelFileClass>
testModel_11__1_class.svm
</SvmModelFileClass>
<SvmModelFileReg>
testModel_11__1_reg.svm
</SvmModelFileReg>
</IonType>
</PrimaryTypes>
<ScalingUpper>
1
</ScalingUpper>
<ScalingLower>
0
</ScalingLower>
<MaxFeatures>
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
36
36
17.5
1
237
237
237
34.3
7530.2
7521.7
7743.5
1.28
1.28
1.28
0.71
5
5
5
10
54.03
45.48
50.24
7.15
7.15
7.15
1.72
37
36
0.972972972972973
6
6
3549.7838724337
3493.76968517507
0.984220395023591
16
16
</MaxFeatures>
<MinFeatures>
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
0
0
202.7
202.7
202.7
-34.3
202.7
202.7
1483.4
0.57
0.57
0.57
-0.71
-5
-5
-5
-10
-54.31
-51
-53.77
5.43
5.43
5.43
-1.72
7
1
0.027027027027027
0
0
727.4956101185
76.039304878271
0.034420156915308
0
0
</MinFeatures>
<SecondaryTypes>
<IntensityLevels>
7
</IntensityLevels>
<IntensityBinBoarders>
0.258871048688889
0.425502896308899
0.552253723144531
0.68602579832077
0.860846161842346
1
</IntensityBinBoarders>
<IntensityBinValues>
0.0317677517853143
0.347397633287455
0.490215009258639
0.618219214238745
0.769292876845406
0.957301887773698
</IntensityBinValues>
<IonType>
8
H3N1
1
<ConditionalProbabilities>
<Region 0>
0.934072345390898
0.0315052508751459
0.0221703617269545
0.0058343057176196
0.00408401400233372
0.00116686114352392
0.00116686114352392
0.746987951807229
0.176706827309237
0.0602409638554217
0.00401606425702811
0.00803212851405622
0
0.00401606425702811
0.766536964980545
0.136186770428016
0.066147859922179
0.0233463035019455
0.00389105058365759
0
0.00389105058365759
0.651340996168582
0.18007662835249
0.118773946360153
0.0383141762452107
0
0.00766283524904215
0.00383141762452107
0.551020408163265
0.212244897959184
0.151020408163265
0.0693877551020408
0.0122448979591837
0
0.00408163265306122
0.463519313304721
0.197424892703863
0.218884120171674
0.0858369098712446
0.0257510729613734
0.00858369098712446
0
0.314285714285714
0.257142857142857
0.233333333333333
0.10952380952381
0.0523809523809524
0.0333333333333333
0
</Region 0>
<Region 1>
0.754216867469879
0.11566265060241
0.0578313253012048
0.0240963855421687
0.0313253012048193
0.0120481927710843
0.00481927710843374
0.724832214765101
0.120805369127517
0.0906040268456376
0.0369127516778524
0.0134228187919463
0.0134228187919463
0
0.684073107049608
0.148825065274151
0.107049608355091
0.0339425587467363
0.0130548302872063
0.010443864229765
0.00261096605744125
0.602649006622517
0.211920529801325
0.1280353200883
0.0375275938189845
0.0154525386313466
0.00441501103752759
0
0.577490774907749
0.219557195571956
0.127306273062731
0.044280442804428
0.0276752767527675
0.0018450184501845
0.0018450184501845
0.518867924528302
0.221698113207547
0.14937106918239
0.0676100628930818
0.029874213836478
0.00943396226415094
0.00314465408805031
0.372549019607843
0.235294117647059
0.225490196078431
0.0994397759103641
0.0476190476190476
0.015406162464986
0.00420168067226891
</Region 1>
<Region 2>
0.929936305732484
0.0509554140127389
0.0141542816702052
0.00353857041755131
0.000707714083510262
0
0.000707714083510262
0.795348837209302
0.13953488372093
0.0465116279069767
0.0116279069767442
0.00465116279069767
0.00232558139534884
0
0.698550724637681
0.194202898550725
0.072463768115942
0.0260869565217391
0.00289855072463768
0.00579710144927536
0
0.620817843866171
0.234200743494424
0.111524163568773
0.0223048327137546
0.0111524163568773
0
0
0.5678391959799
0.276381909547739
0.110552763819095
0.0301507537688442
0.0100502512562814
0.0050251256281407
0
0.51304347826087
0.252173913043478
0.147826086956522
0.0695652173913043
0
0.00869565217391304
0.00869565217391304
0.369230769230769
0.307692307692308
0.215384615384615
0.107692307692308
0
0
0
</Region 2>
</ConditionalProbabilities>
</IonType>
<IonType>
8
H2O1
1
<ConditionalProbabilities>
<Region 0>
0.951536643026005
0.0271867612293144
0.0112293144208038
0.00768321513002364
0.00177304964539007
0
0.000591016548463357
0.816239316239316
0.115384615384615
0.0512820512820513
0.0128205128205128
0.00427350427350427
0
0
0.812244897959184
0.138775510204082
0.036734693877551
0.0122448979591837
0
0
0
0.661290322580645
0.209677419354839
0.092741935483871
0.0241935483870968
0.0120967741935484
0
0
0.605042016806723
0.235294117647059
0.117647058823529
0.0210084033613445
0.0126050420168067
0.00840336134453781
0
0.423963133640553
0.225806451612903
0.211981566820276
0.0783410138248848
0.0460829493087558
0.00921658986175115
0.00460829493087558
0.407407407407407
0.174603174603175
0.17989417989418
0.111111111111111
0.0846560846560847
0.0423280423280423
0
</Region 0>
<Region 1>
0.782051282051282
0.102564102564103
0.0717948717948718
0.0205128205128205
0.0179487179487179
0.00512820512820513
0
0.704545454545455
0.170454545454545
0.0681818181818182
0.0416666666666667
0.00757575757575758
0.00757575757575758
0
0.645833333333333
0.205357142857143
0.0982142857142857
0.0208333333333333
0.0208333333333333
0.00595238095238095
0.00297619047619048
0.638676844783715
0.198473282442748
0.106870229007634
0.0407124681933842
0.0101781170483461
0.00254452926208651
0.00254452926208651
0.548856548856549
0.239085239085239
0.139293139293139
0.0436590436590437
0.0228690228690229
0.00623700623700624
0
0.468239564428312
0.250453720508167
0.157894736842105
0.0816696914700544
0.029038112522686
0.0108892921960073
0.00181488203266788
0.341307814992026
0.240829346092504
0.218500797448166
0.133971291866029
0.0446570972886762
0.0159489633173844
0.00478468899521531
</Region 1>
<Region 2>
0.862559241706161
0.101895734597156
0.028436018957346
0.004739336492891
0.0023696682464455
0
0
0.731517509727626
0.163424124513619
0.0817120622568093
0.0116731517509728
0.00389105058365759
0.00389105058365759
0.00389105058365759
0.651515151515151
0.212121212121212
0.131313131313131
0.00505050505050505
0
0
0
0.647058823529412
0.194117647058824
0.123529411764706
0.0294117647058824
0.00588235294117647
0
0
0.58
0.24
0.1
0.07
0.01
0
0
0.479452054794521
0.205479452054795
0.191780821917808
0.0821917808219178
0.0273972602739726
0.0136986301369863
0
0.431818181818182
0.272727272727273
0.113636363636364
0.113636363636364
0.0454545454545455
0
0.0227272727272727
</Region 2>
</ConditionalProbabilities>
</IonType>
<IonType>
8

2
<ConditionalProbabilities>
<Region 0>
0.527230590961761
0.143105446118192
0.130938586326767
0.0828505214368482
0.0492468134414832
0.0347624565469293
0.0318655851680185
0.433734939759036
0.164658634538153
0.100401606425703
0.120481927710843
0.072289156626506
0.0602409638554217
0.0481927710843374
0.434108527131783
0.174418604651163
0.127906976744186
0.116279069767442
0.0658914728682171
0.0387596899224806
0.0426356589147287
0.469465648854962
0.17175572519084
0.110687022900763
0.0725190839694656
0.049618320610687
0.0687022900763359
0.0572519083969466
0.459349593495935
0.166666666666667
0.134146341463415
0.0691056910569106
0.0731707317073171
0.0569105691056911
0.040650406504065
0.457264957264957
0.141025641025641
0.0982905982905983
0.106837606837607
0.0555555555555556
0.0683760683760684
0.0726495726495727
0.395238095238095
0.128571428571429
0.138095238095238
0.0952380952380952
0.0619047619047619
0.104761904761905
0.0761904761904762
</Region 0>
<Region 1>
0.850917431192661
0.0940366972477064
0.036697247706422
0.0137614678899083
0
0.00229357798165138
0.00229357798165138
0.801980198019802
0.125412541254125
0.0495049504950495
0.0132013201320132
0.0033003300330033
0.0033003300330033
0.0033003300330033
0.808785529715762
0.134366925064599
0.0387596899224806
0.00775193798449612
0.00775193798449612
0.00258397932816537
0
0.801310043668122
0.131004366812227
0.0414847161572052
0.0152838427947598
0.00655021834061135
0.00436681222707424
0
0.78125
0.159926470588235
0.0496323529411765
0.00183823529411765
0.00551470588235294
0.00183823529411765
0
0.772230889235569
0.126365054602184
0.062402496099844
0.0296411856474259
0.0046801872074883
0.0031201248049922
0.0015600624024961
0.706703910614525
0.170391061452514
0.0712290502793296
0.0293296089385475
0.0181564245810056
0.00139664804469274
0.00279329608938547
</Region 1>
<Region 2>
0.996617050067659
0.0013531799729364
0.0013531799729364
0.0006765899864682
0
0
0
0.990888382687927
0.00911161731207289
0
0
0
0
0
0.971181556195965
0.0230547550432277
0.00288184438040346
0
0.00288184438040346
0
0
0.970588235294118
0.0183823529411765
0.00735294117647059
0.00367647058823529
0
0
0
0.955223880597015
0.0398009950248756
0.00497512437810945
0
0
0
0
0.94017094017094
0.0341880341880342
0.0256410256410256
0
0
0
0
0.96969696969697
0.0151515151515152
0.0151515151515152
0
0
0
0
</Region 2>
</ConditionalProbabilities>
</IonType>
</SecondaryTypes>