 .shed.yml
|
110 |
-rw-r--r-- |
|
AccurateMassSearch.xml
|
6271 |
-rw-r--r-- |
|
AdditiveSeries.xml
|
4022 |
-rw-r--r-- |
|
BaselineFilter.xml
|
2857 |
-rw-r--r-- |
|
CVInspector.xml
|
3020 |
-rw-r--r-- |
|
CompNovo.xml
|
223350 |
-rw-r--r-- |
|
CompNovoCID.xml
|
223365 |
-rw-r--r-- |
|
ConsensusID.xml
|
6692 |
-rw-r--r-- |
|
ConsensusMapNormalizer.xml
|
2192 |
-rw-r--r-- |
|
ConvertTSVToTraML.xml
|
2813 |
-rw-r--r-- |
|
DeMeanderize.xml
|
1859 |
-rw-r--r-- |
|
Decharger.xml
|
9193 |
-rw-r--r-- |
|
DecoyDatabase.xml
|
3117 |
-rw-r--r-- |
|
Digestor.xml
|
2574 |
-rw-r--r-- |
|
DigestorMotif.xml
|
2818 |
-rw-r--r-- |
|
EICExtractor.xml
|
4293 |
-rw-r--r-- |
|
ERPairFinder.xml
|
3598 |
-rw-r--r-- |
|
FFEval.xml
|
2549 |
-rw-r--r-- |
|
FalseDiscoveryRate.xml
|
4740 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderCentroided.xml
|
13770 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderIsotopeWavelet.xml
|
5674 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderMRM.xml
|
3542 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderMetabo.xml
|
11011 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderMultiplex.xml
|
10958 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureFinderSuperHirn.xml
|
11986 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureLinkerLabeled.xml
|
4133 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureLinkerUnlabeled.xml
|
6369 |
-rw-r--r-- |
|
FeatureLinkerUnlabeledQT.xml
|
5994 |
-rw-r--r-- |
|
FidoAdapter.xml
|
5574 |
-rw-r--r-- |
|
FileConverter.xml
|
4138 |
-rw-r--r-- |
|
FileFilter.xml
|
32601 |
-rw-r--r-- |
|
FileInfo.xml
|
2959 |
-rw-r--r-- |
|
FileMerger.xml
|
3930 |
-rw-r--r-- |
|
HighResPrecursorMassCorrector.xml
|
1485 |
-rw-r--r-- |
|
IDConflictResolver.xml
|
1407 |
-rw-r--r-- |
|
IDExtractor.xml
|
2071 |
-rw-r--r-- |
|
IDFileConverter.xml
|
4582 |
-rw-r--r-- |
|
IDFilter.xml
|
10654 |
-rw-r--r-- |
|
IDMapper.xml
|
5429 |
-rw-r--r-- |
|
IDMassAccuracy.xml
|
5646 |
-rw-r--r-- |
|
IDMerger.xml
|
2533 |
-rw-r--r-- |
|
IDPosteriorErrorProbability.xml
|
4715 |
-rw-r--r-- |
|
IDRTCalibration.xml
|
2469 |
-rw-r--r-- |
|
IDSplitter.xml
|
1461 |
-rw-r--r-- |
|
ITRAQAnalyzer.xml
|
9339 |
-rw-r--r-- |
|
InclusionExclusionListCreator.xml
|
17240 |
-rw-r--r-- |
|
InternalCalibration.xml
|
3082 |
-rw-r--r-- |
|
IsobaricAnalyzer.xml
|
28071 |
-rw-r--r-- |
|
LabeledEval.xml
|
1832 |
-rw-r--r-- |
|
MRMMapper.xml
|
2218 |
-rw-r--r-- |
|
MRMPairFinder.xml
|
2764 |
-rw-r--r-- |
|
MSGFPlusAdapter.xml
|
224999 |
-rw-r--r-- |
|
MSSimulator.xml
|
74455 |
-rw-r--r-- |
|
MapAlignerIdentification.xml
|
8940 |
-rw-r--r-- |
|
MapAlignerPoseClustering.xml
|
12679 |
-rw-r--r-- |
|
MapAlignerSpectrum.xml
|
9934 |
-rw-r--r-- |
|
MapAlignmentEvaluation.xml
|
2652 |
-rw-r--r-- |
|
MapNormalizer.xml
|
1237 |
-rw-r--r-- |
|
MapRTTransformer.xml
|
6406 |
-rw-r--r-- |
|
MapStatistics.xml
|
2132 |
-rw-r--r-- |
|
MassCalculator.xml
|
4608 |
-rw-r--r-- |
|
MassTraceExtractor.xml
|
7763 |
-rw-r--r-- |
|
MyriMatchAdapter.xml
|
226950 |
-rw-r--r-- |
|
MzTabExporter.xml
|
1758 |
-rw-r--r-- |
|
NoiseFilterGaussian.xml
|
3063 |
-rw-r--r-- |
|
NoiseFilterSGolay.xml
|
2585 |
-rw-r--r-- |
|
OMSSAAdapter.xml
|
226204 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathAnalyzer.xml
|
24955 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathChromatogramExtractor.xml
|
4884 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathConfidenceScoring.xml
|
2891 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathDIAPreScoring.xml
|
2056 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathDecoyGenerator.xml
|
5687 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathFeatureXMLToTSV.xml
|
2452 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathMzMLFileCacher.xml
|
1492 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathRTNormalizer.xml
|
28899 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathRewriteToFeatureXML.xml
|
1858 |
-rw-r--r-- |
|
OpenSwathWorkflow.xml
|
24402 |
-rw-r--r-- |
|
PTModel.xml
|
8052 |
-rw-r--r-- |
|
PTPredict.xml
|
1896 |
-rw-r--r-- |
|
PeakPickerHiRes.xml
|
8613 |
-rw-r--r-- |
|
PeakPickerWavelet.xml
|
19777 |
-rw-r--r-- |
|
PepNovoAdapter.xml
|
220053 |
-rw-r--r-- |
|
PeptideIndexer.xml
|
6471 |
-rw-r--r-- |
|
PrecursorIonSelector.xml
|
20620 |
-rw-r--r-- |
|
PrecursorMassCorrector.xml
|
2672 |
-rw-r--r-- |
|
ProteinInference.xml
|
2469 |
-rw-r--r-- |
|
ProteinQuantifier.xml
|
6593 |
-rw-r--r-- |
|
ProteinResolver.xml
|
4988 |
-rw-r--r-- |
|
RNPxl.xml
|
6726 |
-rw-r--r-- |
|
RTEvaluation.xml
|
2466 |
-rw-r--r-- |
|
RTModel.xml
|
9287 |
-rw-r--r-- |
|
RTPredict.xml
|
3271 |
-rw-r--r-- |
|
SeedListGenerator.xml
|
1799 |
-rw-r--r-- |
|
SemanticValidator.xml
|
2102 |
-rw-r--r-- |
|
SequenceCoverageCalculator.xml
|
1605 |
-rw-r--r-- |
|
SpecLibCreator.xml
|
2103 |
-rw-r--r-- |
|
SpecLibSearcher.xml
|
220600 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterBernNorm.xml
|
1929 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterMarkerMower.xml
|
1290 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterNLargest.xml
|
1455 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterNormalizer.xml
|
1773 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterParentPeakMower.xml
|
3723 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterScaler.xml
|
1265 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterSqrtMower.xml
|
1280 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterThresholdMower.xml
|
1558 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraFilterWindowMower.xml
|
2258 |
-rw-r--r-- |
|
SpectraMerger.xml
|
5559 |
-rw-r--r-- |
|
TMTAnalyzer.xml
|
7738 |
-rw-r--r-- |
|
TOFCalibration.xml
|
22429 |
-rw-r--r-- |
|
TextExporter.xml
|
5946 |
-rw-r--r-- |
|
TransformationEvaluation.xml
|
1922 |
-rw-r--r-- |
|
XMLValidator.xml
|
1580 |
-rw-r--r-- |
|
XTandemAdapter.xml
|
222393 |
-rw-r--r-- |
|
macros.xml
|
1328 |
-rw-r--r-- |
|
readme.md
|
3710 |
-rw-r--r-- |
|
tool_dependencies.xml
|
257 |
-rw-r--r-- |
