Mercurial > repos > dfornika > kma_result_to_mlst
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"planemo upload for repository https://github.com/dfornika/galaxy/tree/master/tools/kma_result_to_mlst commit 62e7cd82cb9b209bf3f797ae288916e88bbe8bc6-dirty"
| author | dfornika |
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--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/SRR6728073_vs_vparahaemolyticus_cgMLST_first_100_loci_mlst.tsv Thu Oct 31 14:12:43 2019 -0400 @@ -0,0 +1,49 @@ +locus_id allele_id template_identity template_coverage depth +VP0001 29 100.0 100.0 10.72 +VP0003 50 99.51 99.51 6.05 +VP0004 3 100.0 100.0 6.4 +VP0005 1 100.0 100.0 39.34 +VP0006 42 100.0 100.0 11.64 +VP0007 8 100.0 100.0 8.64 +VP0012 54 100.0 100.0 13.32 +VP0015 2 100.0 100.0 31.87 +VP0016 13 100.0 100.0 5.97 +VP0018 5 100.0 100.0 9.67 +VP0019 57 100.0 100.0 8.23 +VP0022 2 100.0 100.0 23.02 +VP0025 1 100.0 100.0 4.67 +VP0026 1 100.0 100.0 3.6 +VP0032 35 43.0 43.0 0.71 +VP0034 32 100.0 100.0 23.36 +VP0035 51 100.0 100.0 5.06 +VP0036 3 100.0 100.0 23.51 +VP0038 34 26.93 26.93 0.38 +VP0040 8 100.0 100.0 14.81 +VP0041 38 59.33 59.38 1.09 +VP0042 30 100.0 100.0 4.36 +VP0044 46 100.0 100.0 11.27 +VP0045 9 100.0 100.0 2.71 +VP0047 36 87.3 87.3 1.2 +VP0048 38 100.0 100.0 17.82 +VP0050 54 75.55 77.32 1.58 +VP0055 51 100.0 100.0 33.68 +VP0056 59 78.34 78.34 2.2 +VP0061 8 100.0 100.0 15.6 +VP0069 54 100.0 100.0 8.77 +VP0070 58 98.92 98.97 3.36 +VP0072 3 100.0 100.0 17.43 +VP0073 40 100.0 100.0 5.68 +VP0074 48 58.81 59.34 0.88 +VP0075 50 100.0 100.0 13.39 +VP0076 9 100.0 100.0 2.47 +VP0077 1 100.0 100.0 5.16 +VP0078 1 100.0 100.0 3.09 +VP0079 55 38.36 38.36 0.63 +VP0082 1 80.23 80.23 1.01 +VP0083 1 100.0 100.0 13.18 +VP0086 42 100.0 100.0 6.36 +VP0087 39 100.0 100.0 14.99 +VP0089 43 41.52 41.52 1.27 +VP0093 13 97.14 97.47 2.55 +VP0094 54 53.66 53.66 1.75 +VP0095 46 41.28 41.28 0.7