test-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  tool-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  picard_AddCommentsToBam.xml
 | 
1880 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_AddOrReplaceReadGroups.xml
 | 
3432 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_BedToIntervalList.xml
 | 
3682 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CleanSam.xml
 | 
1464 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
 | 
5310 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectBaseDistributionByCycle.xml
 | 
4569 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectGcBiasMetrics.xml
 | 
4738 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectHsMetrics.xml
 | 
4728 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectInsertSizeMetrics.xml
 | 
6456 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectRnaSeqMetrics.xml
 | 
13765 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectSequencingArtifactsMetrics.xml
 | 
8171 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectWgsMetrics.xml
 | 
4021 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_DownsampleSam.xml
 | 
2712 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_EstimateLibraryComplexity.xml
 | 
8325 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FastqToSam.xml
 | 
10424 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FilterSamReads.xml
 | 
4972 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FixMateInformation.xml
 | 
2817 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicates.xml
 | 
8473 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicatesWithMateCigar.xml
 | 
8697 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MeanQualityByCycle.xml
 | 
4316 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeBamAlignment.xml
 | 
18034 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeSamFiles.xml
 | 
3158 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_NormalizeFasta.xml
 | 
2472 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_QualityScoreDistribution.xml
 | 
4693 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReorderSam.xml
 | 
5178 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReplaceSamHeader.xml
 | 
2181 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertOriginalBaseQualitiesAndAddMateCigar.xml
 | 
2974 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertSam.xml
 | 
8059 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SamToFastq.xml
 | 
12060 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SortSam.xml
 | 
2906 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ValidateSamFile.xml
 | 
13456 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_macros.xml
 | 
6816 | 
-rw-r--r-- | 
  read_group_macros.xml
 | 
11264 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.sample
 | 
385 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.test
 | 
273 | 
-rw-r--r-- |