test-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  tool-data/
 | 
 | 
drwxr-xr-x | 
  picard_AddCommentsToBam.xml
 | 
1902 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_AddOrReplaceReadGroups.xml
 | 
3454 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_BedToIntervalList.xml
 | 
3726 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CleanSam.xml
 | 
1484 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
 | 
5279 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectBaseDistributionByCycle.xml
 | 
4500 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectGcBiasMetrics.xml
 | 
4758 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectHsMetrics.xml
 | 
4744 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectInsertSizeMetrics.xml
 | 
6388 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectRnaSeqMetrics.xml
 | 
12952 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectSequencingArtifactsMetrics.xml
 | 
8118 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_CollectWgsMetrics.xml
 | 
4041 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_DownsampleSam.xml
 | 
2734 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_EstimateLibraryComplexity.xml
 | 
8345 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FastqToSam.xml
 | 
10065 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FilterSamReads.xml
 | 
5012 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_FixMateInformation.xml
 | 
2837 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicates.xml
 | 
8505 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MarkDuplicatesWithMateCigar.xml
 | 
8752 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MeanQualityByCycle.xml
 | 
4336 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeBamAlignment.xml
 | 
18100 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_MergeSamFiles.xml
 | 
3178 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_NormalizeFasta.xml
 | 
2492 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_QualityScoreDistribution.xml
 | 
4713 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReorderSam.xml
 | 
5123 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ReplaceSamHeader.xml
 | 
2096 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertOriginalBaseQualitiesAndAddMateCigar.xml
 | 
2994 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_RevertSam.xml
 | 
8079 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SamToFastq.xml
 | 
11077 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_SortSam.xml
 | 
2926 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_ValidateSamFile.xml
 | 
11658 | 
-rw-r--r-- | 
  picard_macros.xml
 | 
6931 | 
-rw-r--r-- | 
  read_group_macros.xml
 | 
11275 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.sample
 | 
385 | 
-rw-r--r-- | 
  tool_data_table_conf.xml.test
 | 
273 | 
-rw-r--r-- |