Mercurial > repos > devteam > indels_3way

comparison test-data/3way.maf @ 0:79112aff0ccc draft default tip

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded tool tarball.
author devteam
date Tue, 20 Aug 2013 10:59:06 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:79112aff0ccc
1 ##maf version=1
2 a score=56674.0
3 s hg18.chr1 46772 143 + 247249719 TTACAGAAACTCAGAATGATTCTAT----TTTTTCTTTTATATTTGTATATGTTTTTCCAATACCTCTGAAAAAACTGATCCAAAAAAAA--TACAAATTTTAATTGTAGCCAGTCAATTCAGGAAGGATAAAGGTCAAAAACTTTCAA
4 s panTro2.chrUn 9712379 145 + 58616431 TTACAGAAACTCAGAATGATTCTAT----TTTTTCTTTTATATTTGTATATGTTTTTCCAATACCTCTGAAAAAACTGATCCAAAAAAAAAATACAAATTTTAATTGTAGCCAGTCAATTCAGGAAGGATAAAGGTCAAAAACTTTCAA
5 s canFam2.chr30 39837824 145 - 43206070 TTACAAACACTCAAAATAACTCCCTATATTTTTCCTCTTTTGTGTTTGTATGTTTTCCACTGATCTCTTAAGAAATTGATCCAATAATG---TACAAATTTTACTTTTAGTCAGTTAACTCAGAAAAAATAAAG-TTAAAAGCACTCAA
6
7 a score=597116.0
8 s hg18.chr1 46915 1380 + 247249719 AGAAACCTTCAGCCCCAACACACTAAACTTTGGGAGCACAGGTTGGCATCCAGAGGTAAACATTTGCTATAACTGATAACAGGAGAAGGATCCATTTATTCACCTGTTATCAATTACAGGCATTGTATTTAAAGATCAGATGTTTTATATTTATTTCTTCAAATTTCATTCATGGTGCCATAAGTGAAGGTATCTCTGTCCACCCTGAATATATTTTCACTCCC--------TCATCTCAGTCATTCCGAACAATTCACACACTAAGATTACCCATGCTAAATGGGGATTCTTTTTTACTAGCCAATGTAGTACCTCAAATCCTTCCTTCCCTCCCCCTATTTCATCAGCAGGCAAT---TCTTTTGATACTTTTGTCAAGGGGAAATTG-TGTGACTCAGAGATCTAGT-CCCCAAGAGAAACTAATAATGGGCTGGGTATTGTCTGTCTCAGCAGCATCAGTGGGTCCCTCTCCTGTGCAGCTAATTAGCTTCCTTTCCAATATGAAGAATCTTATATATAGCTTTGTCTTTGGGGT-------ATTACATAAATGAAGATTAAGCTATCTGAATTTCTCCTTCTCCTAAAAATGCACATCCTATGACTGAAAAGACAGGTAAAAGAGATGC-TTTTAATTACAAAACTTT----------CCCTGTCGTGGTTGCT----TCTCTCTATCCTTCTAAACTCCCTTTCAATTTCTTCTCTTCTGTAACATATTTGTGCCCAAAATCTTCTGCTTTCTGAAATATTTT-ATCTTTTTCTTCCACACTATCTCT---TATTTTCCAATTTTAATCATTAAATTATATTATGTCTTATAAAACTAATCCCACATATAAAC-----CCCTATGATAATTTCAGTTTGTCCC--TAGTATGAAGTTCTTTAAAGATGTGTAGTTTTCTAACTTTCATGCTCTCCAATTAATTATAAACTTCATTTTCCAC--TCTGAAAAGGAGATGTCTGATCTCAGCTATTTCCATCCTATTTGAAAACCAGATTTAGTTTTAAACCAGAGGAAGGGAATCTCAAGTCTTTACCTCCCACAGTCTGGTGTGATTCTCTCTCTTTTGGTATTACCTTCCTCCACATTGGAACACTCCAGCCAATGCATAGGCTGAGAGGCTAT-CTCAGATTCAGAAAGATT-TGGCCTCATCCCAGGGGAGGGTACAGAGGAGCTGATGACTATGAATTCTGAAATGG----AACTGTTCCAGG--------------TTGAAGAAATAAGAAAGGGAATTGGGAAGAGCAATGCCCAGTGAAAAAGAAGAAATAATATTTTAGGAAGTGAATGCTAATTTTATTTTAAACAAAATAAGAACTCAAGGAATAAGAGGGTTCTTCCAA-TAGGTTAGAGTGATCCTGTCAAACATATATGCTTCTAGATTTTTTTAAAGACTGTTTCTACT
9 s panTro2.chrUn 9712524 1384 + 58616431 AGAAACCTTCAGCCCCAACACGCTAAACTTTGGGAGCACAGGTTGGCATCCAGAGGTAAACATTTGCTATAACTGATAACAGGAGAAGGATCCATTTATTCACCTGTTATCAATTACAGGCATTGTATTTAAAGATCAGATGTTTTATATTTATTTCTTCAAATTTCATTCATGGTGCCATAAGTGAAGGTATGTCTGTCCACCCTGAATATATTTTCACTCCC--------TCATCTCGGTCATTCCGAACAATTCACACACTAAGATTACCCATGCTAAATGGGGATTCTTTTTTACTAGCCAATGTAGTACCTCACATCCTTCCTTCCTTCCCCCTATTTCATCAGCAGGCAAT---TCTTTCGATACTTTTGTCAAGGGGAAATTG-TGTGACTCAGAGATTTAGT-CCCCAAGAGAAACTAATAATGGGCTGGGTATTGTCTGTCTCAGCAGCATCAGTGGGTCCCTCTCCTGTGCAGCTAATTAGCTTCCTTTCCAATATGAAGAATCTTATATATAGCTTTGTCTTTGGGGT-------ATTACATAAATGAAGATTAAGCTATCTGAATTTCTCCTTCTCCTAAAAATGCACATCCTATGACTGAAAAGACAGGTAAAAGAGATGC-TTTTAATTACAAAACTTT----------CCCTGTCGTGGTTGCT----TCTCTCTATCCTTCTAAACTCCCTTTCAATTTCTTCTCTTCTGTAACATATTTGTGCCCAAAATCTTCTGCTTTCTGAAATATTTT-ATCTTTTTCTTCCACACTATCTCT---TATTTTCAAATTTTAATCATTAAATTATATTATGTCTTATAAAACTAATCCCACATATAAAC-----CCCTATGATAATTTCAGTTTGTCCC--TAGTATGAAGTTCTTTAAAGATGTGTAGTTTTCTAACTTTCATGCTCTCCAATTCATTATAAACTTCATTTTCCAC--TCTGAAAAGGAGATGTCTGATCTCAGCTATTTCCATCCTATTTGAAAACCGGATTTAGTTTTAAACCAGAGGAAGGGAATCTCAAGTCTTTACCTCCCACAGTCTGGTGTGATTCTCTCTCTTTTGGTATTACCTTCCTCCACATTGGAACACTCCAGCCAATGCATAGGCTGAGAGGCTAT-CTCAGATTCAGAAAGATT-TGGCCTCATCCCAGGGGAGGGTACAGAGGAGCTGATGGCTATGAATTCTGAAATGG----AACTGTTCCAGG----------TTGTTTGAAGAAATACGAAAGGGAATTGGGAAGAGCAATGCCCAGTGAAAAAGAAGAAATAATATTTTAGGAAGTGAATGCTAATTTTATTTTAAACAAAATAAGAACTCAAGGAAAAAGAGGGTTCTTCCCA-TAGGTTAGAGTGATCCTGTCAAACATATATGCTTCTAGATTTTTTTAAAGACTGTTTCTACT
10 s canFam2.chr30 39838143 1415 - 43206070 AGAAGACTTTATCTTCAACACTCCAAAGTTTGGGACTGCAGGTAAATCTACAAAGGTAAACACTGGCTATAATTGATAACAGAAAAGTGATCTATTTATTCCCCTACTGTCAGTTGTAAGAATTATCTTTACATATCAGAGCTTTTATATCTATCTCTTCAAGTT-------TGGTACTACAAGTGAAGATATATCTGTCCATTTAGGTTATGTTTTCACACCCTCATCCCATCATCTCAGTACTTTCAAACAATTCATGC-CAAATATCATGTAACCTATACAGGGATATTTTTACACAAACCAATATATTGCCTCAAAATCTTCCCTCTTCCTCTTGGTTTCATAACCAGGCAATTTCTCTTTCACTATTTCTCTCATGGGAAAACCAATGTGATTCAAGGATTTAGTCCCCCAAGAGGAACAAATAATGGGCTCAGTATTGGCCTTCTCTGAGACAACAGTAGGTCACTCTCCTGTGTGCCTAATTAACTTATTTTCCATTTAGAAGAATATTATATATAGCTTTGTCTTTGAAGGAAGATTATATACAGATATTAAGACTAAGCTCTCTGAACTACTATTTTT-CCAAAAATGTAAATCCTGTGGCTGAACAGGCAGGTAGGAAAACTGCTTTTTAATTATAAAACTACAAGGGATGCAACCGGTCATGGTTGCATCCCTTGCTCTATCCCCCTTAACACTGCTTCAGTGTTTGCTCTTCTGTAAAATATCTGCATCAGAAATTTTCTCCTTTTGAAAATAGTTTCATCCTTTTATTCTACACCATCACTCTCTATTCTCAAATTGCAATCACTGAATTGCAT--TGTCTTATCAAATCGATTCCACACACACACACACATCTTTTGATATGTTTAATTTATCTCCTTGATGTGAAAATTTTTCAAGATTCATGTGCTTCTGATTTTTGTGCTCTCCAACTCATTTTAAAATTTTCCCCCCGCTGTATAAAAAAGAGACATTTGGCCTTAATTATTTCTACCTTATTTGAGAACCAAATTTTGTTTTAAACCAGAGGGAGGAAATCTCAATCCTCAACTTCCAGGATTCTGGTGTGATTCCCTCCCCTTCAGTATTAATTTCCTCTGCATTGGAAGGAACCAGCCAATGCCTAGTCTGAGAGGCTGTGCTCAGAGTCAAAGAGCTTCTGGTCCTGTGCCAGGGGATGGTAGAGGGGAACTGGTGGTTATAAATTCTGAGATGGAAGTAAGTGTTCAAGGACTGACTAGTTTGTGTGAAGAAACAGGAAAGCGGGTTAGGAAGAGCAAG---------------ATAAAT-GTCTTTCAGGAAG-GAAGGCCAATTTTATTTTAAAT-GAATAAAAACTCATGGTTGAATAGGATACTTTCAGTTAGGTTAGAGTGATCCTTTGAAATATAAATAATTCTAGCTTTTTTCA-----TGACTCTATT
11
12 a score=213480.0
13 s hg18.chr1 48332 455 + 247249719 CTGGAATTTAGGAGGTCTGCCTTCTGATTCTGACTTCTTGAATGTATT---------------GTTAGCCATTTAACCACACTGTGTTGTTTCTCATTCTACCTGTAGAA---------------------TCTCAAAGTTCTTTCCCACTTCTATACAAAACTATAATTCTGAACATCCTTTTTGTTTAATATAAGTCTGCATTTCCTGTTTGAAGATATGTGTCCC-AGACCCTAAATGACTGACAAATTTTAAATCTCCAATAGGAAAGATGACAAACTCTATGGAAACTTGGCTTCTGAAGAACTCCTAGAAGCTTTCCAAAGTCATCAGTGTTTCCTAAGAAGGCAGAGAAATCAAACACATGGTCTTTTCCTCCAGACAAGCTCCTTTGGGTCATCAGGATTTCTTCAACAATAAAATGTAATAATTCCAAATGTTTGTAACAGAATGGGTAGGACTTTCTTCACTTATTTAAATACTCCCTTTTT
14 s panTro2.chrUn 9714242 455 + 58616431 CTGGAATTTAGGAGGTCTGCCTTCTGATTCTGACTTCTTGAATGTATT---------------GTTAGCCATTTAACCACACTGTGTTGTTTCTCATTCTACCTGTAGAA---------------------TCTCAAAGTTCTTTCCCACTTCTATACAAAACTATAATTCTGAACATCCTTTTTGTTTAATATAAGTCTGCATTTCCTGTTTGAAGATATGTGTCCC-AGACCCTAAATGACTGACAAATTTTAAATCTCCAATAGGAAAGATGACAAACTCTATGGAAATTTGGCTTCTGAAGAACTCCTAGAAGCTTTCCAAAGTCATCAGTGTTTCCTAAGAAGGCAGAGAAATCAAACACATGGTCTTTTCCTCCAGACAAGCTCCTTTGGGTCATCAGGATTTCTTCAACAATAAAATGTAATAATTCCAAATGTTTGTAACAGAATGGGTAGGACTTTCTTCACTTATTTAAATACTCCCTTTTT
15 s canFam2.chr30 39839594 483 - 43206070 ctagaagttagg----ctgacttctagttctggatctgtgaacatactgctgtgaacacactggctagccatttaccctcatggggttggctc----tctacacgtacaaggaagtaactgaaaaagattctctcaaagttctttcccacttctatacacgtctataattctGA-TATCCTTTTTGTTCAATATGTATCTATATTTCCTGTTTAATGATGGGTCTTCCTAGACCCTGAATAACTGAAAAAGTTTACATCTCCAAGAGGAAGGATACCAAACTGTATGGGAACTTGGCCTCTGAGAAATTCTTGAGAGCTTCACAAAGTCATCAGAGTTTTCTAAAAAGGCAGAGAAACCAAGTGCATGGTCTTTTTCTCCCAGCAAGCTCTCTCTGGTCATAAGGATTTCCTCATCAATGATACATGCTAATTCCAGACATCTGGAAGAAGGGGGGTAGAAATTTCTTCACTCAGTTAAATACTCATTTTTT
16
17 a score=83239.0
18 s hg18.chr1 52524 183 + 247249719 TTTTATGCATTC--------TTTTCCAGTTTCTTAAGATG-CTAATAAGTTCATGTATTTGAGCAATTGAGAAC-ATTTAAAGCAATAGACTGCCTCTGAGCACAGCTTTGTCCATATTACATTAACCTTTTATACCCTGGGTTCCCACTAGTTTTTAAATAATCTACTATCAAATAA----AAGATTTGTTAATAA
19 s panTro2.chrUn 9718427 183 + 58616431 TTTTATGCATTC--------TTTTCCAATTTCTTAAGATG-CTAATAAGTTCATGTATTTGAGCAATTGAGAAC-ATTTAAAACAATAGACTGCCTCTGAGCACAGCTTTGTCCATATTACATTAACCTTTTATACCCTGGGTTCCCACTAGTTTTTAAATAATCTACTATCAAATAA----AAGATTTGTTAATAA
20 s canFam2.chr30 39841235 193 - 43206070 TTTTATACATCCTTTTCTAGTTTTCTAGTTTCTTAAATTGCCTGCTTACTCCATGTACATGAACAAATAAGAGCAATTTAAAGCAATAGACTGCCTCTGAGTGCAGCTTTGGTCATACTACCAAA----CTCATATCCCGGGTTCCCATTAATTTGTAAATAATTTACTATCAATTAAATACAAGATCTGTCAATAG
21
22 a score=28580.0
23 s hg18.chr1 52707 115 + 247249719 TAA---ATTTTAAATCATTAACACTTAACGCATTATTTTCAGTCACACTAA-GTTGATTCC----TTCGTTTCTTTCAGGTTGCTTCAGAGTCTTCCCTTCTATCTGATTCAGTGGACCAAGT
24 s panTro2.chrUn 9718610 115 + 58616431 TAC---ATTTTAAATCATTAACACTTAACGCATTATTTTCAGTCACACTAA-GTTGATTCC----TTCCTTTCTTTCAGGTTGCTTCAGAGTCTTCCCTTCTATCTGATTCAATGGACCAAGT
25 s canFam2.chr30 39841428 118 - 43206070 ---CTAGTATTAAATTATCAACATTCAAGACATTTTTTT--AGTACCTTAACATTGATTCCCTTTCTCATTTCTTTCAGATCACTTCAGAGTCTTCTCTTCCTTATGATTCAATGGACCAAGT
26
27 a score=751514.0
28 s hg18.chr1 52822 1040 + 247249719 AAATGACTCTCTGGTAACAGAATTTGTATTACTTGGACTTGCACAATCCTTGGAAATGCAGTTTTTCCTTTTTCTCTTCTTCTCTTTATTCTATGTGGGAATTATCCTGGGAAAACTCTTCATTGTGTTCACAGTGATCTTTGATCCTCACTTACACTCCCCCATGTATATTCTGCTGGCCAACCTATCGCTCATTGACTTGAGCCTTTCATCTACCACAGTTCCTAGGTTGATCTACGATCTTTTTACTGATTGTAAAGTTATTTCCTTCCATAATTGCATGATACAAAAGTTCTTTATCCATGTTATGGGAGGAGTTGAAATGGTGCTGCTGATAGTCATGGCATATGATAGGTACACTGCGATCTGCAAGCCTCTCCACTATCCAACTATTATGAATCCCAAAATGTGCATGTTTTTGGTAGCAGCAGCTTGGGTCATTGGGGTGATTCATGCTATGTCTCAGTTTGTTTTTGTCATAAATTTACCCTTCTGTGGCCCTAATAATGTGGGGAGCTTTTATTGTGATTTTCCTCGGGTTATTAAACTTGCATGCATGGACACTTATGGGCTAGAATTTGTGGTCACTGCCAACAGTGGATTCATATCGATGGGCACCTTCTTTTTCTTAATTGTATCATACATTTTTATTCTGGTCACTGTCCAACGACATTCCTCAAATGATTTATCCAAAGCATTCTTCACTTCGTCGGCTCACATCACCGTAGTGGTTTTGTTTTTTGCTCCATGCATGTTTCTCTACGTGTGGCCTTTCCCTACTAAGTCATTGGATAAATTTTTTGCCATCATGAACTTTGTTGTCACCCCTGTCGTAAATCCTGCCATCTATACTTTAAGGAACAAAGATATGAAGTTTGCAATGAGAAGGCTGAATCAACATATTTTAAATTCTATGGAGACGACATAACACATTTGGTTGATGAGAGCACAGGATAAATGCCATGGACCATCAAGACTCCTGTGATCACCATGATCACTATGGAACGCGCACATTTTTAGTATTGCC-TGAAAAAACTGAA
29 s panTro2.chrUn 9718725 1040 + 58616431 AAATGACTCTCTGGTAACAGAATTTGTATTACTTGGACTTGCACAATCCTTGGAAATGCAGTTTTTCCTTTTTCTCTTCTTCTCTTTATTCTATGTGGGAATTATCCTGGGAAACCTCTTCATTGTGTTCACAGTGATCTTTGATCCTCACTTACACTCCCCCATGTATATTCTGCTGGCCAACCTATCGCTCATTGACTTGAGCCTTTCATCTACCACAGTTCCTAGATTGATCTATGATCTTTTTACTGATTGTAAAGTTATTTCCTTCCATAATTGTATGATACAAATGTTCTTTATCCATGTTACGGGAGGAGTTGAAATGGTGCTGCTGATAGTCATGGCATATGATAGGTACACTGCGATCTGCAAGCCTCTCCACTATCCAACTATTATGAATCCCAAAATGTGCATGCTTTTGGTAGCAGCAGCTTGGGTCATTGGGGTGATTCATGCTATGTCTCAGTTTGTTTTTGTCATAAATTTACCCTTCTGTGGCCCTAATAATGTGGGGAGCTTTTATTGTGATTTTCCTCGGGTTATTAAACTTGCATGCATGGACACTTACGGGCTAGAATTTGTGGTCACTGCCAACAGTGGATTCATATCTATGGGCACCTTCTTTTTCTTAATTGTATCATACATTTTTATTCTGGTCACTGTCCGACGACATTCCTCAAATGATTTATCCAAAGCGTTCTTCACTTCGTCGGCTCACATCACCGTAGTGGTTTTGTTTTTTGCTCCATGCATGTTTCTCTACGTGTGGCCTTTCCCTACTAAGTCATTGGATAAATTTTTTGCCATCATGAACTTTGTGGTCACCCCTGTCTTAAATCCTGCCATCTACACTTTAAGGAACAAAGATATGAAGTTTGCAATGAGAAGGCTGAATCAACATATTTTAAATTCTATGGAGACGACATAACAGATTTGGTTGATGAGAGCACAGGATAAATGCCATGGACCATCAAGACTCCTGTGATCACCATGATCACTATGGAACGCGCACATTTTTAGTATTGCC-TGAAAAAACTGAA
30 s canFam2.chr30 39841546 1041 - 43206070 AAATGGCTCTTTGGTAACTGAATTTGTGTTACTGGGACTTGCACAATCCTTGGGAATGCAGATTTTCCTTTTTGTTTTTTTCTCTTTATTCTATGTTGGAATTATCTTAGGAAACCTCTTCATTATGTTAACAGTGATTTTTGATTCTCACTTACACTCCCCAATGTATATCCTGCTGGCCAACCTATCACTCATTGATGTGGGCCTTTCATCCACCACAGTTCCTAGAATGATCTCTGATCTTTTCAGTGGTTGTAAAATCATTTCCTTCCACAACTGCATGATACAAATGTTCTTTATTCATGTTATGGGAGGAGTTGAGATGGTGTTGCTCATAGCCATGGCATTTGACAGGTACACAGCGATCTGCAAGCCTCTCCACTATCTCACTACCATGAATACCAAAACGTGCATGCTTTTGGTAGTGGCTGCTTGGATCATTGGGGTGATTCATGCTGTATCTCAGTTTGTTTTTGTCATAAATTTACCTTTTTGTGGCCCTAATAATGTAGGGAGCTTTTATTGTGATTTTCCTAGGGTTATTAAACTTGCATGCATGGACACATACAGACTAGAATTTGTGGTCACTGCCAACAGTGGCTTCATATCTATGGGCACATTCTTTTTCTTAATTGTATCATACATCTTTATTCTGGCCACTGTTAGACAGCATTCTTCAAAAGACTTGTCCAAAGCATTTGTCACTCTGTCAGCTCACATCACTGTGTTGGTTTTGTTTTTCACTCCATGCATGTTTCTCTATGTGTGGCCTTTCCCTACCAAGTCAATGGATAAATTTTTTGCCATTGTGGATTTTGTTATCACTCCTGTATTAAATCCTGCCATCTATACTCTAAGGAACAGAGATATGAAGGTGGCAATGGGAAGGCTGAGTCGACAAGTTGTAAGTTCTAGAGACATACCATAACAGATTTTATTGGTAAGAGCACAAGATGAATGTTGTGGACCTTCAGGACCCTCGTGATCACCATGAACACTATGGATTATGTACAATTTCATTATTGCCTTTAAAAAACTGAG
31
32 a score=139278.0
33 s hg18.chr1 53862 335 + 247249719 AAATCTGC----AAAAAGGATGCATTAAATCTAAGAATTGTA-TTTCAGATAAAGTTGCAACATT-TTTTGTTAATCATAAAA--------AGTATATATTTCTATCTAATGTGTGTATCTAA-------TTAACAGCAATGACTACCTTTAATTTTGATGTAGTTATTTTATATCTGTATATAAGCACATACACATATATATGACCTAGGTTTATTTATCAGTATTTTTATGCTGATAATAAGCATCACTGGAAATTAAT-----TTTCTTATGGAAATTATGTGGATCCAATGGATAAAATATGAGTTTATATAAATTAGTAAATGC-CAAAATCAAGGAAGAAACAATTTTTATTTTAA
34 s panTro2.chrUn 9719765 335 + 58616431 AAATCTGC----AAAAAGGATGCATTAAATCTAAGAATTGTA-TTTCAGATAAAGTTGCAACATT-TTTTGTTAATCATAAAA--------AGTATGTATTTCTATCTAATGTGTGTATCTAA-------TTAACAGCAATGACTATCTTTAATTTTGATGTAGTTATTTTATATCTGTATATAAGCACATACACATATATATGACCTAGGTTTATTTATCAGTATTTTCATGCTGATAATAAGCATCACTGGAAATTAAT-----TTTCTTATGGAAATTATGGGGATCCAATGGATAAAATATGAGTTTATATAAATTAGTAAATGC-CAAAATCAAGGAAGAAACAATTTTTATTTTAA
35 s canFam2.chr30 39842587 356 - 43206070 ATATCTATGTAAAAAAAGGAT--ATTAAATCAAAGAACTATACTTTCAAATAGGGTTGCTGTAATAATCTGTTAAGTATGAAAAATAAAGTGTCATACATTCCTACCTAACCTATAAAACTAAGTTGCAATTATCATCAATGACCACATTCAATTTTCATGTAATTGTTTTATATCTCTATATAAATATATACATGTACATATGATTGAGC----TTTATCAGTATCTTCATACTGATCATAAGCATCACTGGAAATCAATTAATGTTTCTTATAGAAATTATGTGGATCCAATGGATAAAATATGAGTTTATACAAACCAGCAGCCATGAAAAATCAAGAAAGAAACAATTCTTATCCTAA
36
37 a score=268726.0
38 s hg18.chr1 54530 582 + 247249719 AGACTCTAGTACTCTGTATTATGCAAAATTTGTCTATGTTACACTTTTTT-AACAACACAATCCTATTGCCCTTGAAATCTTCTTCAAAGCATTTCTCGAGTCACTCTTAAAAAGCATCTACAACC-TAAAAGTATAGGAAGAGATTTATTTCCTGGAGAAGAG-ACCCCATTGAGATCTTAAAAGCACATTTAATGTGCCTGTGCTTAACTTAAGGT----GCTTAGGACAAAGAAGGCGATTGACATCTTT------------------CAGGTAAAACCTGGTAAGTTTGGT-GGTCAAGGAACACAACTGAGACATCACTTGGATGTATTCCTATGACTATTTTAAGAAACATAAATTGTGGTGACTCACTCAGCTCACTTTTAACTACTGCATGGTAATTAAAGATGCAAAATAAAATAAGTTACAAGAAGTGAGG----TTTTTTATTGGTTAAAGCAATTTTT-CTATATTTTCTCCGCAAGTTGGTCATAAAAGTTCTAAGCATTCCTCTTTTTATAAAATCGAAGCATTATTACTTACTCTCTTGTTAACCTATCTGGATTTTAATTTTGTAACTTTATTATATTTGTTTTGCTGTGATTCTTT
39 s panTro2.chrUn 9720721 585 + 58616431 aGACTCCAGTACTCTGTATTATGCAAAATTTGTCTATGTTACACTTTTTT-AACAACACAATCCTATTGCCCTTGAAATCTTCTTCAAAGCATTTCTCGAGTCACTCTTAAAAAGCATCTACAACC-TAAAAGTATAGGAAGAGATTTATTTCCTGGAGAAGAG-ACTCCATTGAGATCTTAAAAGCACATTTAATGTGCCCGTGCTTAACTTAAGGTAGGTGCTTAGGACAAAGAAGACGATTGACATCTTT------------------CAGGTAAAACCTGGTAAGTTTGGT-GGTCAAGGAACACAACTGAGACATCACTTGGATGTATTTCTATGACTATTTTAAGAAACATAAATTGTGGTGACTCACTCAGCTCACTTTTAACTACTGCATGGTAATTAAAGATGCAAAATAAAATAAGTTACAAGAAGTGAGG----TTTTTTATTGGTTAAAGCAATTTTT-CTATATTTT-TCCGCAAGTTGGTCCTAAAAGTTCTAAGCATTCCTCTTTTTATAAAATCGAAGCATTATTACTTACTCTCTTGTTAACCTATCTGGATTTTAATTTTGTAACTTTATTATATTTGTTTTGCTGTGATTCTTT
40 s canFam2.chr30 39843049 600 - 43206070 AGATTCTAGCATTTTGCATTATGCAAAATTTGTCTGTGTTCTATTTTTTTCAACAGCAAATTTCTGTTGTCCTTGCAGTCTTCTTCAAAGCATTTCTTGATTCAC-CCTAAAGAGTATCTACAATTATAAAAGTATTTTAAGGATCTTATTACCTAAAGAAAGGTACTCAACTCAGATCTCAA---CTTATTTAATGTACCTGTTCTTAAGCCAGGGT----GCTTAGGACAAAGAAGATGATTGACATCTTTACTTTTACTTTACTTTTCCAAATAAAACTTGGAAAGTCTGATGGGTCAAGGAGCACAATTGAGAAATCACTTGGGTATATTCCTGTGACTAATATAAGAAATGTAAATTGTAGTGACTA----AACTCGGTTGTAACTGCTGCATTGTAGTTAAAGCTGTTCAATAAAATGGCAAATAATGAATGAGACTTTCTTATTATTGGTCGAGGTATTTTTCCCTATATTTTATCCA-AAATTAGTCATAAGTGCTATAAGCTCTCCTCTTTTTATAATATCAAAGCATTATTATTTATTGTCTTCTTAATCCATCTGGATTTTAATTTCAGAACTTTATCTTATTGGTTTTACTATGATTCTTT
41
42 a score=149740.0
43 s hg18.chr1 55112 367 + 247249719 AAAAAGCACCTTTAGACTCAGTGAGATAGCAAAAATATCCAAATAGGCCAAAAAATTGTGGCAATGTCCTCTCACTCAGGAAAATTCTGTGTGTTTTCTCTAATGGCCAAGGGAAAACTTGTGAGACTATAAAAGTTAGTCTCAGTACACAAAGCTCAGACTGGCTATTCCCAGATCTCTTCAGGTACATCTAGTCCATTCATAAAGGGCTTTTAATTAACCAAGTGGTTTACTAAAAAGGACAATTCA-CTACATATTATTCTCTTA-CAGTTTTTATG-----------------------------------CCTCATT-CTGTGAAAATTGCTGTAGTCTCTTCCAGTTATGAAGAAGGTAGGTGGA--AACAAAGACAAAACACATATATTAGAAGAATGAA
44 s panTro2.chrUn 9721306 402 + 58616431 AAAAAGCACCTTTAGACTCAGTGAGATAGCAAAAATATCCAAATAGGCCAAAAAATTGTGGCAATGTCCTCTCACTCAGGAAAATTCTGTGTGTTTTCTCTAATGGCCAAGGGAAAACTTGTGAGACTATAAAAGTTAGTCTCAGTACACAAAGCTCAGACTGGCTATTCCCAGATCTCTTCAGGTACATCTAGTCCATTCATAAAGGGCTTTTAATTAACCAAGTGGTTTACTAAAAAGGACAATTCA-CTACATATTATTCTCTTA-CAGTTTTTATGCTTCAAGGCAGTGCAAATAAAGGGAAATTTGTACTCCTCATT-CTGTGAAAATTGCTGTAGTCTCTTCCAGTTATGAAGAAGGTAGGTGGA--AACAAAGATAAAACAAATATATTAGAAGAATGAA
45 s canFam2.chr30 39844287 382 - 43206070 AAAAATCATCTTTAGATTC-GTGAGGTAGTAGAAATACCTAAGTGAGCAAATAGCTTGAGATGACAGTCCCTAACTCAAGAAGATTTTGTGTGTATGTCCT------TAAGGGAAAACCAGTGACACTATATGACTTAGTCTCAGTACTCAAACTTCAGGCTGGATATTTCCAGATCTCCTCAACTGCCTCTGGTC-ATTCATAAATGGCTC----TTAACCAAGTGG-------AGGAGGATGATTCAGACAGACTTTATTCTCTTGGAAATTTT--TCCTTCAAGACAAAGTGCAAAATGGAAAATCTGTACTCTTCCTTGCTCTGAAAATTGCCGTAGCATCTTCCAGTTATGAAGGAGGTAGGTGGAATAATGATCATGAA----CTATATTAGCAGAACTAA
46
47 a score=103163.0
48 s hg18.chr1 55740 272 + 247249719 TCTTTCCCCAGGTCCGGTGTTTTCTTACCCACCTCCT-TCCCTCCTTTTTATAATACCAGTGAAACTTGGTTTGGAGCATTTCTTTCACATAAAGGTACAaatcatactgctagagttgtgaggat-----ttttacagcttttgaaagaataaactcattttaaaaacaggaaagctaaggcccagagatttttaaatgatattcccatgatcacactgtgaatttgtgccagaa--cccaaatgcct--actc-----------------------------------ccatctcactgaGACTTACTATAAGGA
49 s panTro2.chrUn 9721736 307 + 58616431 TCTTTCCTCAGGTCCGGTGTTTTCTTACCCACCTCCT-TCCCTCCTTTTTATAATACCAGTGAAACTTGGTTTGGAGCATTTCTTTCACATAAAGGTACAaatcatactgctagagttgtgaggat-----ttttagagcttttgaaagaataaactcattttaaaaacaggaaagctaaggcccagagatttttaaatgatattcccatgatcacactgtgaatttctgccagaa--cccaaatgcct--actcccaatatatattatataaatataacatatattttaCCATCTCACTGAGACTTACTATAAAAA
50 s canFam2.chr30 39844941 265 - 43206070 ATATACTTCAGATTCAGTGTTCTTTTACCCACCTTTTCCCCCTCTTTCCTGCAATCCCAATGAAGTCTGTTTTAGGATATTTCTTTCACATAAAGGTGCAAATCATACTCCTAACATTGTGGAATTTTGTCTTTAAGAGCTTTTGATCCAAAGAGCTCA-----------Ggaaaactaaggcttggaga-ttctaaatgacatg-tcaaaatcacacagtaaat-tgtactaatattcccaaatctcctgactt-----------------------------------caaTCTCAGTGAAATT---TATGAAGA
51
52 a score=1417.0
53 s hg18.chr1 56012 19 + 247249719 CATAAGGCatttatatata
54 s panTro2.chrUn 9722043 19 + 58616431 CATAATACATTTTtatata
55 s canFam2.chr30 39845206 19 - 43206070 CTTTAGGCATTTTTCTTTA
56
57 a score=335729.0
58 s hg18.chr1 56589 802 + 247249719 GATTCTGAAGGACTCCTTTAATAAGCCTAAACTTAATGTTCAACTTAGAATAAATACAATTCTTCTAATTTTTTTTGAATAATTTTTAAAAAGTCAGAAATGAGCTTTGAAAGAATTATGGTGGTGAAGGATCC---------------------------------CCTCAGCAGCACAAATTCAGGAGA-GAGATGTCTTAACTACGTTAGCAAGAAATTCCTTTTGCTAAAGAATAGCATTCCTGAATTCTTACTAACAGCCATGATAGAAAGTCTTTT-GCTACAGATGAGAACCCTCGGGTCAACC-TCATCCTTGGCATATTTCATGTGAAGATAT-AACTTCAAGATTGTCCTTGCCTATCAATGAAATGAATTAATTTTATGTCAATGCATATTTAAGGTCTATTCTAAATTGCACACTTTGATTCAAAAGAAACAGTCCAACCAACCAGTCAGGACAGAAATTATCTCACAATAAAAATCCTATCGTTTGTACTGTCAATGATTAGTATGATTATATTTATTACCGTGCTAAGCAGAAGAGAAATGAAGTGAATGTTCATGATTTATTCCACTATTAGACTTCTCTTTATTCTTAAAAATA--TTTAAGATCACTAAATTTTTATAGGACTTTAAAAACAGTAATGTGCTGCTTTGAGTGTGTAGGACTAAGAAATGGGATTCAGAGTAGTAAAGAGAAAAGTGGAATTTCCAAGCACTATGAATTACTGTTCTTTAAAAAACAGCAAAAATCAAATAACAGTATTCCTCCAAAAAAGATGGCAAGTGTAAACT-CTATACCTTCATGTCTCCCGTGGAATGTTAGTGATCAA
59 s panTro2.chrUn 9723768 801 + 58616431 GATTCTGAAGAACTCCTTTAATAAGCCTAAACTTAATGTTCAACTTAGAATAAATACAATTCTTCTAAATTTTTTTGAATAATTTTTGAAAAGTCAGAAATGAGCTTTGAAAGAATTATGGTGGTGAAGGATCC---------------------------------CCTCAGCAGCACAAATTCAGGAGA-GAGATGTCTTAACTACGTTAGCAAGAAATTCCTTTTGCTGAAGAATAGCATTCCTGAATTCTTACTAACAACCATGATAGAAAGTCTTTT-GCTACAGATGAGAACCCTCGGGTCAACC-TCATCCTTGGCATATTTCATGTGAAGATAT-AACTTCAAGATTGTCCTTGCCTATCAATGAAATGAATTAATTTTATGTCAATGCATATTTAAGGTCTATTCTAAATTGCACACTTTGATTCAAAAGAAACAGTCCAACCAACCAGTCAGGACAGAAATTATCTCACAATAAAAATCCTATCATTTGTACTGTCAATGATTAGTATGATTATATTTATTACCGTGCTAAGCAGAAGAGAACTGAAGTGAATGTTCATGATTTATTCCACTATTAGACTTCTCTTTATTCTTAAAAATA--TTTAAGATCACTAAATTTTTATAGGACTTTAAAAACAGTAATGTGCTGCTT-GAGTGTGTAGGACTAAGAAATGGGATTCAGAGTAGTAAAGAGAAAAGTGGAATTTCCAAGCACTATGAATTACTGTTCTTTAAAAAACAGCAAAAAACAAATAACAGTATTCCTCCAAAAAAGATGGCAAGTGTAAACT-CTATACCTTCATGTCTCCCGTGGAATGTTAGTGATCAA
60 s canFam2.chr30 39845358 805 - 43206070 GATTCTGGAGAACTTCTTCAGT------AAACTTAATATCTAACTTAGAATCAAAAGAATTCTTCTAAAACCCCTTGAACCGCTTTTGAAGAATCAGATATGAGCTT-GAAAGGATTACAGCAGTGAAGGATCCCCTGTAACTGAGAATCCCCTATCATCACTCACTCCTCAGTAGCATATACTCAGGAAATGAGATGTCTTAACTAAGTGAACAAGAAATTCTTTTTGCTGAAGTACAGCATATCTGAATTCTGACTTGTTACCATGGTATAAAGTCTTTTCACTGCAAAAGAGAAACCACTGGTCAGCTATCACCCTTGGTATATTTCTTATGGAGATATGAGCATCGAATTCATCC-------TCAGTGAAATGAGATGGTTGTACATAAGTAAATATTGAATTTCCATTCTAAGTTGCATACTTTGATTCTTAAC---CATCCTAACCAATCAGTCACATCAGAAATGATCTCACAATAAGAATACCATCCTCTTTATTGTCAGTGATTACAATGATTGTATTTACTACTGTGCTAAGCAGAAGGGAACAGAGG-----GTTTATTTCTTGTTTTACTCTTAGACTTCTCCTTATACTTGAAAATAAAATTAGAATTGTCAAATTCTTACAGGACTTTGAAAGCAGTAATAAGGAGCAT-TAG-GGATAGGGCTAAGGAATGGGATTTGGAAT-----AATGAAAAGTGTAACTTCCAAGGGTGTTGCAATAACCACAATCAGGCAGTGTTGAAAA--AAATAATACCACTCCTCCAAAAAATTTGGTAAGAGTAACCCACTATATTTTCACATGTCCCTAGGACC--TATTGA----
61
62 a score=65626.0
63 s hg18.chr1 58409 176 + 247249719 ttctcacttcacttttgaattccctattcttttatcctctgttaatttttaagtattatatttgtgatattattttttctttttttctattttttatctttcatttcattttggcctattt--ttttctcttAAGAACTTTAATATCACCAAATAACATGTGTGCTACAAACTGTTTT
64 s panTro2.chrUn 9725587 176 + 58616431 ttctcacttcacttttgaattccctattcttttatcctctgttaatttttaagtattatatttgtgatattattttttctttttttctattttttatctttcatttcattttggcctattt--ttttctcttAAGAACTTTAATATCACCAAATAACATGTGTGCTACAAACTGTTTT
65 s canFam2.chr30 39846454 148 - 43206070 ---TCATTTCATTTCTAAATCACCT-TTCTTTAATCC--TATTATTTTCATGCTATTTTAT--------TTATTTTTTC-----TTCTATTTTTCATCTTT------ATTATGGGCTAACTCTTTTTCTTCTAAGCATTTCAATATCACTAAATGATA-----ACTACAAATTCTATT
66
67 a score=986811.0
68 s hg18.chr1 58585 1628 + 247249719 GTAGTTCAAAGAAAAAGGAGATAAACATAGAGTTATGGCATAGACTTAATCTGGCAGAGAGACAAGCATAAATAATGGTATTTTATATTAGGAATAAACCTAACATTAATGGAGAC-ACTGAGAAG-CCGAGATAACTGAATTATAAGGCATAGCCAGGGAAGTAGTGCGAGATAGAATTATGATCTT------GT-TGAATTCTGAATGTCTTTAAGTAATAGA---------------TTATAGAA---------AGTCACTGTAAGAGTGAGCAGAATGATATAAAATGAGGCTTTGAATTTGAATATAATAATTCTGACTTCCTTCTCCTTCTCTTCTTCAAGGTAACTGCAGAGGCTATTTCCTGGAATGAATCAACGAGTGAAACGAATAACTCTATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGAACTCCAGACCTTCCTATTTATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTGGAAACCTTCTTATTGTCATAACAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCTCCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTCTTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAGTCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTTGGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATATAGCAATATGCAAGCCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCATGTGTCGGCATTATGGCTGTCACATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTGAGCCAGTTGGCGTTTGCCGTGCACTTACTCTTCTGTGGTCCCAATGAGGTCGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAGATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACTGTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGACCATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGACTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATTTATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATTTTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGAACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACAGCTGAGAAAATGGGATGCACATTCTAGTGTAAAGTTTTAGATCTTATATAACTGTGAGATTAATCTCAGATAATGACACAAAATATAGTGAAGTTGGTAAGTTATTTAGTAAAGCTCATGAAAATTGTGCCCTCCATTCCCATATAATTTAGTAATTGTCTAGGAACTTCCACATACATTGCCTCAATTTATCTTTCAACAA-CTTGTGTGTTATATTTTGGAATACAGATACAAAGTTATTATGCTTTCAAAATATTCTTTTGCTAATTCTTAGAACAAAGAAAGGCATAAATATATTAGTATTTGTGTACACCTGTT----CCTTCCTGTGTGACCCTAAGTTTAGTAGAAGAAAGGAGAGAAAATATAGCCTAGCttataaatt
69 s panTro2.chrUn 9725763 1631 + 58616431 GTAGTTCAAAGAAAAAGGAGAAAAACATAGAGTTATGGCATAGACTTAATCTGGCAGAGAGACAAGCATAAATAATGGTATTTTATATTAGGAATAAACCTAACATTAATGGAGAC-ACTGAGAAG-CCGAGATAACTGAATTATAAGGCATAGCCAGGGAAGTAGTGCGAGATAAAATTATGATCTTT-GGTTGT-TGAATTCTGAATGTCTTTAAGTAATAGA---------------TTATAGAA---------AGTCACTGTAAGAGTGAGCAGAATGATATAAAATGAGGCTTTGAATTTGAATATAATAATTCTGACTTCCTTCTCCTTCTCTTCTTCAAGGTAACTGCAGAGGCTATTTCCTGGAATGAATCAACGAGTGAAACGAATAACTCTATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGAACTCCAGACCTTCCTATT-ATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTGGAAACCTTCTTATTGTCAGAATAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCTCCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTGTTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAGTCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTTGGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATATAGCAATATGCAAACCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCATGTGTCGGCATTATGGCTGTCGCATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTGAGCCAGTTGGCCTTTGCCGTGCACTTACCCTTCTGTGGTCCCAATGAGGTCGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAGATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACTGTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGACCATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGACTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATTTATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATTTTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGAACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACGGCTGAGAAAATGGGATGCACATTCTAGTGTAAAGTTTTAGATCTTATATAACTGTGAGATTAATCTCAGATAATGACACAAAATATAGTGAAGTTGGTAAGTTATTTAGTAAAGCTCATGAAAATTGTGCCTTCCATTCCCATATAATTTAGTAATTGTCTAGGAACTTCCACATACATTGCCTCAATTTATCTTTCAACAA-CTTGTGTGTTATATTTTGGAATACAGATACAAAGTTATTATGCTTTCAAAATATTCTTTTGCTAATTCTTGGAACAAAGAAAGGCATAAATATATTAGTATTTGTGTACACCTGTT----CCTTCCTGTGTGATCCTAAGTTTAGTAGAAGAAAGGAGAGAAAATATAGCCTAGCttataaa-t
70 s canFam2.chr30 39847579 1623 - 43206070 GGAGTTCAAGGGAAAAGAAGTTAAATGTAGGATGGTGGTATAAACTTAATCTGGCAGACAAAGTAGCATGAAAAAAGGTACTTT-CATTAGGAATAAGCTTAGCATAAGTGGAAATAACTGAGCAGACTTGAGTAACTGGACTATAAAGCATAATCAAAGAACGAGTGTGATATAAAAATGGAGGGTTTAGATTGTGTACAATTTGAAAGCCTTTATGATATAAAGGCTTTTTCTGTGCTTTATAGCACTATATAATAGTCATTATATGAGTGAGCAGAATGACATAAAAGGAGACT---AACTGAAATATAATAATTTTGACTTCCTTCTTACTCTATTCTCCAAGGTAACTACACCGGCTGTTTCCTGGAATGAATCAATAAGTGACATGAATTACTCCATGGTGACTGAGTTCATTTTTCTGAGACTCTCTAATTCTCAGGAATTGCAGATTTTCCCTTTTGTGTTCTTTGTTGTATTCTATGTAGGAATTGTGTGTGGAAACCTTCCTATTGTCATAACTGTGGCCTCTGACTCCTACCTTCACTCCCCCTTGTACTTCCTGCTGGCTAACCTCTCACTCATTGACCTATGTCTGTCTTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTGCTGACATTTTTAGTAAACACAAAGTCATTTCTTTCAAGGGCTGCCTTGCTCAGCTATTTATCCTTTACTTTTTTGGTGGGAGCAAGCTGGTGATCCTTATAGCCATGGCCTTTGACAGATATGTAACAATCTGTAAACCACCTCGCTACACTACAGTTATGTG----------TGTGTTGGCCTTGTGGCTGCTGCATGGGGAACTGGCTTCCTCCATTCAGTCAGCCAGCTGGCCTTTGCAGTGAACTTACCTTTCTGTGGTCCCAATGAGGTTGACAGTTTTTATTGTGACCTCCCTAGGGTTATCAAACTTCCTTGTACAGATATCTATAGGTTGGATATCATGGTCATTGCTAACACTGGTGTGCTCACTGTGTGTTC-TTTATTTTCCTAATCATCTCCTATGCTATCATCCTAGTGACCATCCAGCAACACCCTTCAGACAAGTCATCCAAGGCACTGTCCACTTTGACTGCTCACGTCACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTATCTTCATTTATGCCTGGCCATTCCCCATGAAGTCATTAGATGAATTCCTTCCTGTGTTTTATTATGTGGTCACTCCTGTCTTGAACCCAATTATATATACACTGAGGAACAAGGACATGAAGACTGCACTGAAATGGCTGAGAAAATGGCATGTAAACTCTAGGGTAAAGTCTTAAATCTCTCATAATTGTA-----------AGATAATGAC-----ATATGGTAAAGTTGGTGAATTACTTAGGAAACCTCATGAAAATCTTACTTTCTATTTCCATATCCCTTAATAATTATCTAAGAGGTTTCACATACACTGCCTCAATTTATCCTTTGACACTTTTGCATTTTATATTTTTG------GATACAAAGTTGATATGTTTTTAAAATATTATTTCACTAATCCTCAGAACAGT----GGCATAAATCTGTCAATATCTGTATATTCCTCTGGCTACCTACCTGAGAGGTCCTGAGTGTAACTGATGGAA--ACACAGAAACTAGCCTGGTTTATAATTT
71
72 a score=85144.0
73 s hg18.chr1 60306 230 + 247249719 TATATGTCAACTTTTAAGAGG-TTGAAAAACAAACGCCTCCCATTATAA--GTTTATACTTCACCTCCCACCACTATAACAACCCAGAA-TCCATGAGGGCATTATCAGGAGTGAGTGGAAGAGTAAGTTTGCCAATGTGAAATGTGCCTTCTAGGTCCTAGACG-TCTGTGGTAT-----AACTGCTCATAAGCAGTAGAAAGAATTTAGAGGGATCCAGGCTCTCATCACGTTGGCAC
74 s panTro2.chrUn 9727487 230 + 58616431 TATATGTCAACTTTTAAGAGG-TTGAAAAACAAACGCCTCCTATTATAA--GTTTATACTTCACCTCCCACCACTATAACAACCCAGAA-TCCATGAGGGCATTATCAGGAGTGAGTGGAAGAGTAAGTTTGCCAATGTGAAATGTGCCTTCTAGGTCCTAGACA-TCTGTGGTAT-----AACTGCTCATAAGCAGTAGAAAGAATTTAGAGGGATCCAGGCTCTCATCATGTTGGCAC
75 s canFam2.chr30 39849231 218 - 43206070 TATAAGCTAACTTTTAAGAGGTTTAGAAAAGAAACTCCTCACATTGTTATGGTTCATAGTTCCTCTCCAATCACTATAGCAACTTAAAATTCCATGAG----TTATCAGGAATGACAAGAAGAGTGAGTCTGCCAACCCAAAAGTTGCCTTATAGACACTTGACATCCTGTTGCATACAAGAAGAGCCCATTTGTAGTAAAAAATACTTA--------CAAACT----------TGGCAC
76