Mercurial > repos > devteam > fasta_formatter

view test-data/fasta_formatter2.out @ 1:2cbdd2fc365b

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Remove spurious version strings.
author Dave Bouvier <dave@bx.psu.edu>
date Tue, 26 Nov 2013 12:42:19 -0500
parents f7d3b87e9851
children
line wrap: on
line source

>Scaffold3648
AGGAATGATGACTACAATGATCAACTTAACCTATCTATTTAATTTAGTTCCCTAATGTCA
GGGACCTACCTGTTTTTGTTATGTTTGGGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTAATCTGAAGG
TATTGTGCATTATATGACCTGTAATACACAGTATAACTTTTCAAATACTTTTGTTTTACA
ACTTTTCTCTCTGGACTTATATTAAAGTCAATTTTAATGAACATGTAGTAAAAACTAATA
CATGTACATCTACAGTTTATTTATTTTTTTCTTCTTCTTTTTGTATTTCTTGTGTTACAT
TATTTCACTTCACGTTCATGTTACCAACCTTGCCCCCTTGCTTTCCATGCAAAAAAAGAA
AAAAAAGAAGCAATACTTACACTTACCCTTGAGATATCTTGATCTGAATGCTTTAACATT
CTATATGTACAATAAATTTTTGTATCTATAGCCTATTATTATATATGTTGCTATGTCAGG
CACATTGACAACATTCTCAGAAGGTTAGAAGATGGTATTGTTCTGAAATGCCTGGAATGC
CTTGTGAACTAAGATGATTACTCATGTCATTAAAGTCCCCTAACCCAGGTATTTCCTCCT
TCCCATGACGAAAACAGTCCATTTAAACTTCACCCCACTTTGGACCCGAAAGTGGGGTGC
ATTTTGGTGGTAAGCTCACCACAGAGCAAGAGAGAGTTAGAGTCCCTAATCTGCAGTGTA
AACAAACTTTGCCAGGACATCACCAGCCCAACCTTGATAAGTACTGCTTGGAACTCCTCC
ATGATGTTCTAGTCTTATTCGCAGTCTCATATAGGTTCGGATTTTGTCCATTCTCATAGC
TACCAGTATACATGGGAGATGCCAGTTTCATCTTCCTTGCTTCACTTTATAAGCATAGTT
ATATCANGAACTTCCTGGTTATAATTATGTTCCTTTCAAGTTTCATCATAATTGTCTAGT
TCGATATAGTACATGGACACAATTAAATATGATATTGTCT
>Scaffold9299
CAGCATCTACATAATATGATCGCTATTAAACTTAAATCTCCTTGACGGAGTCTTCGGTCA
TAACACAAACCCAGACCTACGTATATGACAAAGCTAATAGGAAAAGCATCCTTGTTTGTT
TCACTATGCTTTTTAATGGTTGACGTTAAaggtaaagaccagtattggaaacgccccaat
ttcaaaaaatgaaatggaagctctcattaccaatcatgtgaaagaatatgttttgactaa
tacatgatgataaaaaaattgccgggaaaccgcctactaattcatatatttagtaaattt
gtttctctcatggtctgtgagagatatagggtagtcccatatacatctttctgtgtatag
tgcttgtaactttacgaagaatgggccaaatttcttatcattttgatgattccagaacct
tgcagatgcgagatggtagatgatcaaccttttctgatcgattccataacgtttctttca
caatgcaatcgcatgaccataactggtctttacctTTAAGTTGTAGGTCTTAATTGATAA
CACTATATAGTTTTTTTCTTTTTACTGTTTTTATTAATGACCTCTGTAATTTGCCCTATT
GTGAAAATACTAAAATATGTTTATACGCCGATGATGCGGCAATATTTTGCCAAGGCAAAG
AAATTGCCCTTGTTGAGAAAACTCTTAAATGTGAGTTTAAAAAAATAGTTGATCACATTG
AAAAAGATGACTTAATGTTGAATATCAAGAAGTGTAAGATCATGTTATTTGGGACAAGAA
AACGAATCAAAAATCAAAGTGTACGCTTGATTTACAGAGATAATGTTATCGAAGTTGTAA
ATGAATTTAAATATCTTGGTGTATTATTTGATAATTATTTAAAGTGGGATATACATATAT
CGAAAACTGCCTCCAAAATATCTAGAACCATATCATGTATAAAACGAATTAAATATTATT
TGCCGAAAAGAATTTTAAAATTGTTATATGATAGTTTGATATTGTCACATATTGACTACG
GTATTGTTTTGTGGGGATGTTCAGCAAAGTGTCATTTGGAAAAGTTACAAAAGTTACAAA
ATCGTTATGCCCGTTTAATACTAAACGTAGATATTTTGACACCTCGTATTATATTATTAT
CCTCTCTAAGATGGCAATCAGTTGTTCAGAGAGTGCAATACCAA
>Scaffold9309
GAAGGAAGAAGAGGAAAATAATGATGAATTTGTAGAATTTCTATAACGTATGAAAACATA
AACAACATGAAAAAGTATGAACCGACAGAAGAATGAAAATTTCAATCATATAACATGTCA
TTCACTTCTCTTCTCTGACTGTCAAGTATTAGGTATTCCTTTTTATTTCCTCTTAAAATG
ATCATAGTTTCCTATTTCTTTTACACCATTGGGAAGGGAATTCCAATGTTTTATGGCATT
GTAATAAAACGAATTTCCAATACTACCTACTCTTTCTGGTAAGTTAAAGTTGAATCGGCT
ATTTCTTGTATTATAATCATGTACGTCAGTAACAAGATCGAAGTTGGATCGAATATAATG
ATTCGACCTAGTATGATATATTTTATGCACGTGATGCAATACGAGTTGTTTTGATCTTTG
GTCGACTTCAAGAAAACCAGCTTTAGAAAGTTCGCTGTAGCCAACATGAGTTCTTGCCTT
GGACTAGAACAGTTGATAAATCTCACCATTTTGTTCTTTAAGATGGGTAGAAGAATCCCT
GCAATCTAAATGGTCAATTACTGTGAAGTTATTTTTACTGGATGCACCCAATAttttttt
gataatttttttttctttgataatttttttctttttctttaataaattttttggataatt
tttttttggataaatagttcttttttgataattctaataatttttttatttatttttttt
ttttctataattttttttaaaaaatttattaatttttaattaaaaaaaaaataaGAGTTA
ACAGATTAAGGGAAACTGACAATTCAAAAAAAAAAAAAA
>Scaffold9310
GCGGGGGCTGGGGAGGAAGGGGTGGCGTTATTTCACTTCCGATCTAATACGCTTTCTTAA
GACACTGAAATATCAGTAGGTATTGGTATAGAGAATTACTTTTTATTTTTAATTAAAACA
TTATCGAAATGAAGATACAGAGAAAAACGATGAGATGTAAGAAGTGCGCGTATTTAtgtg
tgtgggtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgcgtgcgtgtgtgtggtggtgtgt
ACTAATTTTGATGTGTGTTGTGGCACAATTGCAATCATCAGTATCTTCATGAAAATGATA
ACCAGAAGCACAAAAAGGAGGgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtttagtgtgcgtgcgtgt
gagggtgtttaagtgtgtatgtCGGAAATGTGGCACAATTGCAATCATCTGTATCTTCAT
GAAAATGATAACCAGAAGAACAAAAAAAAAAAACATTGAGAGAACATGTTTTTTTGATGG
AAGACAAGAAGTTCTCGTAACGTAGGATCTCCGAGACATGATGGGGTCAACTTAAAAAGA
GAGCAGTGAGAGGCATTTATATCGAAGGTCAGGGAAAGGCAAACAAAGAAAGAAAAAAAA
AAGGCTCACAGGAGAACGAAAACACGGGCCAAAATAATAAACAGGAGCAAGTGAACGGGC
AGTTTGGTAGCTACTTCATTTACCGGCTTTTAAaggtactatgtcccatttgcaggtcaa
aaaaaatgaaaaagttaaattccaactgcatttgaaagataatactaatttacaacttcc
ctaaaaaaggtggggcttgaaaatgtcttcaagtgcggaaaataacgactattagttgtc
aaatcgactttagggCTATAGAGCCCAAAAGTAATAGTCTTGA
>Scaffold11911
TTCTTGGCACCCCCCCCCCCCCCACACTCCTGCACTGAAGAACTACTCAAGTTTAAACTT
TGCATTGCTTTTCTTTCTTTTTCAGTATTTTTTGCTTGGTACATGTTTCTCTTAATATCT
GTCGTATAGatttttaatatttttatttatatCTACGTCAATCTGGCTGttctttttctt
gtcttctttttttttctctctcttttttttcctcgtattttGTATTGATCCTTACCCTAG
TTTTTGAACTTGAACAGCAATTTGCAGCACTCAAATTTCTTTAAAATTACCTTCTCTTAT
TTGtctctgttcccctctccccccctctctctctctctctctctctctctctctctctct
ttcATCTCCCATATCATAATTTGAAGTACCATCTATGGTGTTTTCAGATTGATCTTTCTT
GCTTTCCCCACCCTCCCCCTTTATGCAGTTAATTTTCAGTCTATTTGTGTTTTCTGTGGT
TGATTCTAATCATATTCTAACTCTTATTTTACATTTTACTTCACTAACAACTGGTTTATT
ATATTTGTTACTAATTTTGAATTAAACTATTTACCATTCTGAACGAACTGAAAGATTAAA
GATCAAACTATCTATGAATAGAATGGTATTTCTTCAATTTATTCAAATTTCTCTCTCTTT
AACCCCCTTTTTCTGCTTGCATTTTTATCCCTTTGCCGTGGACTTCACTGGATATTTTGC
TTTGATGCCAATCCAACAATTTTGCATATATTA